Protein–RNA interactions for Protein: Q04712

RRN11, RNA polymerase I-specific transcription initiation factor RRN11, yeastyeast

Predictions only

Length 507 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
RRN11Q04712 AHP1YLR109W 531 nt3.34□□□□□ -1.87
RRN11Q04712 YLR347W-AYLR347W-A 141 nt3.34□□□□□ -1.87
RRN11Q04712 PIN3YPR154W 648 nt3.34□□□□□ -1.87
RRN11Q04712 DER1YBR201W 636 nt3.34□□□□□ -1.87
RRN11Q04712 PBP2YBR233W 1242 nt3.34□□□□□ -1.87
RRN11Q04712 DAN4YJR151C 3486 nt3.34□□□□□ -1.87
RRN11Q04712 YLR108CYLR108C 1458 nt3.34□□□□□ -1.88
RRN11Q04712 YJR061WYJR061W 2808 nt3.34□□□□□ -1.88
RRN11Q04712 STP2YHR006W 1626 nt3.33□□□□□ -1.88
RRN11Q04712 FAS1YKL182W 6156 nt3.33□□□□□ -1.88
RRN11Q04712 TRX3YCR083W 384 nt3.33□□□□□ -1.88
RRN11Q04712 NHP10YDL002C 612 nt3.33□□□□□ -1.88
RRN11Q04712 RUB1YDR139C 234 nt3.33□□□□□ -1.88
RRN11Q04712 YDR271CYDR271C 372 nt3.33□□□□□ -1.88
RRN11Q04712 FMP32YFL046W 624 nt3.33□□□□□ -1.88
RRN11Q04712 OST5YGL226C-A 261 nt3.33□□□□□ -1.88
RRN11Q04712 RSM27YGR215W 333 nt3.33□□□□□ -1.88
RRN11Q04712 YKL091CYKL091C 933 nt3.33□□□□□ -1.88
RRN11Q04712 ECM4YKR076W 1113 nt3.33□□□□□ -1.88
RRN11Q04712 SFH1YLR321C 1281 nt3.33□□□□□ -1.88
RRN11Q04712 ILV5YLR355C 1188 nt3.33□□□□□ -1.88
RRN11Q04712 SAM37YMR060C 984 nt3.33□□□□□ -1.88
RRN11Q04712 YNL035CYNL035C 1170 nt3.33□□□□□ -1.88
RRN11Q04712 RHO5YNL180C 996 nt3.33□□□□□ -1.88
RRN11Q04712 RUF5-1RUF5-1 710 nt3.33□□□□□ -1.88
RRN11Q04712 RUF5-2RUF5-2 710 nt3.33□□□□□ -1.88
RRN11Q04712 TRM112YNR046W 408 nt3.33□□□□□ -1.88
RRN11Q04712 USV1YPL230W 1176 nt3.33□□□□□ -1.88
RRN11Q04712 ERV15YBR210W 429 nt3.33□□□□□ -1.88
RRN11Q04712 ESC2YDR363W 1371 nt3.33□□□□□ -1.88
RRN11Q04712 STP1YDR463W 1560 nt3.33□□□□□ -1.88
RRN11Q04712 RRP5YMR229C 5190 nt3.33□□□□□ -1.88
RRN11Q04712 ASI1YMR119W 1875 nt3.33□□□□□ -1.88
RRN11Q04712 EMP70YLR083C 2004 nt3.32□□□□□ -1.88
RRN11Q04712 DSL1YNL258C 2265 nt3.32□□□□□ -1.88
RRN11Q04712 TAF1YGR274C 3201 nt3.32□□□□□ -1.88
RRN11Q04712 CAF130YGR134W 3369 nt3.32□□□□□ -1.88
RRN11Q04712 HTB1YDR224C 396 nt3.32□□□□□ -1.88
RRN11Q04712 YHL044WYHL044W 708 nt3.32□□□□□ -1.88
RRN11Q04712 ANB1YJR047C 474 nt3.32□□□□□ -1.88
RRN11Q04712 YJR111CYJR111C 852 nt3.32□□□□□ -1.88
RRN11Q04712 RPL22AYLR061W 366 nt3.32□□□□□ -1.88
RRN11Q04712 YLR271WYLR271W 825 nt3.32□□□□□ -1.88
RRN11Q04712 YAR075WYAR075W 474 nt3.32□□□□□ -1.88
RRN11Q04712 YMR141CYMR141C 309 nt3.32□□□□□ -1.88
RRN11Q04712 YNR025CYNR025C 360 nt3.32□□□□□ -1.88
RRN11Q04712 snR11snR11 258 nt3.32□□□□□ -1.88
RRN11Q04712 YPR153WYPR153W 423 nt3.32□□□□□ -1.88
RRN11Q04712 YPR148CYPR148C 1308 nt3.32□□□□□ -1.88
RRN11Q04712 YGL176CYGL176C 1665 nt3.32□□□□□ -1.88
RRN11Q04712 CPA2YJR109C 3357 nt3.32□□□□□ -1.88
RRN11Q04712 KAP104YBR017C 2757 nt3.31□□□□□ -1.88
RRN11Q04712 RRM3YHR031C 2172 nt3.31□□□□□ -1.88
RRN11Q04712 SAG1YJR004C 1953 nt3.31□□□□□ -1.88
RRN11Q04712 UBX5YDR330W 1503 nt3.31□□□□□ -1.88
RRN11Q04712 YDR261W-AYDR261W-A 1317 nt3.31□□□□□ -1.88
RRN11Q04712 RPS29BYDL061C 171 nt3.31□□□□□ -1.88
RRN11Q04712 YDR042CYDR042C 603 nt3.31□□□□□ -1.88
RRN11Q04712 YDR442WYDR442W 393 nt3.31□□□□□ -1.88
RRN11Q04712 YGL006W-AYGL006W-A 111 nt3.31□□□□□ -1.88
RRN11Q04712 LIF1YGL090W 1266 nt3.31□□□□□ -1.88
RRN11Q04712 IKI1YHR187W 930 nt3.31□□□□□ -1.88
RRN11Q04712 MRPL49YJL096W 486 nt3.31□□□□□ -1.88
RRN11Q04712 ECM9YKR004C 1134 nt3.31□□□□□ -1.88
RRN11Q04712 MOH1YBL049W 417 nt3.31□□□□□ -1.88
RRN11Q04712 CIN2YPL241C 807 nt3.31□□□□□ -1.88
RRN11Q04712 HUT1YPL244C 1020 nt3.31□□□□□ -1.88
RRN11Q04712 YBR287WYBR287W 1284 nt3.31□□□□□ -1.88
RRN11Q04712 UTP5YDR398W 1932 nt3.31□□□□□ -1.88
RRN11Q04712 CDH1YGL003C 1701 nt3.3□□□□□ -1.88
RRN11Q04712 TSC13YDL015C 933 nt3.3□□□□□ -1.88
RRN11Q04712 snR83snR83 306 nt3.3□□□□□ -1.88
RRN11Q04712 MIX14YDR031W 366 nt3.3□□□□□ -1.88
RRN11Q04712 MTC3YGL226W 372 nt3.3□□□□□ -1.88
RRN11Q04712 PEF1YGR058W 1008 nt3.3□□□□□ -1.88
RRN11Q04712 ENT3YJR125C 1227 nt3.3□□□□□ -1.88
RRN11Q04712 RCN1YKL159C 636 nt3.3□□□□□ -1.88
RRN11Q04712 REC102YLR329W 795 nt3.3□□□□□ -1.88
RRN11Q04712 OCA2YNL056W 594 nt3.3□□□□□ -1.88
RRN11Q04712 YOR152CYOR152C 771 nt3.3□□□□□ -1.88
RRN11Q04712 MGE1YOR232W 687 nt3.3□□□□□ -1.88
RRN11Q04712 DGA1YOR245C 1257 nt3.3□□□□□ -1.88
RRN11Q04712 YPR136CYPR136C 513 nt3.3□□□□□ -1.88
RRN11Q04712 HPA2YPR193C 471 nt3.3□□□□□ -1.88
RRN11Q04712 AEP2YMR282C 1743 nt3.3□□□□□ -1.88
RRN11Q04712 TFC1YBR123C 1950 nt3.29□□□□□ -1.88
RRN11Q04712 TLG1YDR468C 675 nt3.29□□□□□ -1.88
RRN11Q04712 SVP26YHR181W 687 nt3.29□□□□□ -1.88
RRN11Q04712 CAB2YIL083C 1098 nt3.29□□□□□ -1.88
RRN11Q04712 RPL19BYBL027W 570 nt3.29□□□□□ -1.88
RRN11Q04712 YMR122W-AYMR122W-A 255 nt3.29□□□□□ -1.88
RRN11Q04712 YMR158C-AYMR158C-A 138 nt3.29□□□□□ -1.88
RRN11Q04712 YOR073W-AYOR073W-A 234 nt3.29□□□□□ -1.88
RRN11Q04712 YOR082CYOR082C 342 nt3.29□□□□□ -1.88
RRN11Q04712 Q0017Q0017 162 nt3.29□□□□□ -1.88
RRN11Q04712 CCM1YGR150C 2595 nt3.29□□□□□ -1.88
RRN11Q04712 RPA190YOR341W 4995 nt3.29□□□□□ -1.88
RRN11Q04712 SIN3YOL004W 4611 nt3.28□□□□□ -1.88
RRN11Q04712 YDL162CYDL162C 357 nt3.28□□□□□ -1.88
RRN11Q04712 YIR014WYIR014W 729 nt3.28□□□□□ -1.88
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 25.8 ms