Protein–RNA interactions for Protein: Q04048

SYF1, Pre-mRNA-splicing factor SYF1, yeast

Predicted RBP Predictions only

Length 859 aa.

Protein		RNA				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	UniProt Accession	Gene	Ensembl Transcript ID	Length	Transcript Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
SYF1	Q04048	STU2	YLR045C	2667 nt		3.71	□□□□□ -1.82
SYF1	Q04048	PWP2	YCR057C	2772 nt		3.71	□□□□□ -1.82
SYF1	Q04048	RAD5	YLR032W	3510 nt		3.71	□□□□□ -1.82
SYF1	Q04048	YDR131C	YDR131C	1671 nt		3.71	□□□□□ -1.82
SYF1	Q04048	REB1	YBR049C	2433 nt		3.71	□□□□□ -1.82
SYF1	Q04048	ZDS2	YML109W	2829 nt		3.71	□□□□□ -1.82
SYF1	Q04048	EPL1	YFL024C	2499 nt		3.7	□□□□□ -1.82
SYF1	Q04048	PHO81	YGR233C	3537 nt		3.7	□□□□□ -1.82
SYF1	Q04048	MRPL32	YCR003W	552 nt		3.7	□□□□□ -1.82
SYF1	Q04048	CLB3	YDL155W	1284 nt		3.7	□□□□□ -1.82
SYF1	Q04048	ECM11	YDR446W	909 nt		3.7	□□□□□ -1.82
SYF1	Q04048	YDR464C-A	YDR464C-A	189 nt		3.7	□□□□□ -1.82
SYF1	Q04048	PRE8	YML092C	753 nt		3.7	□□□□□ -1.82
SYF1	Q04048	CPR8	YNR028W	927 nt		3.7	□□□□□ -1.82
SYF1	Q04048	snR11	snR11	258 nt		3.7	□□□□□ -1.82
SYF1	Q04048	IRC13	YOR235W	315 nt		3.7	□□□□□ -1.82
SYF1	Q04048	DGA1	YOR245C	1257 nt		3.7	□□□□□ -1.82
SYF1	Q04048	SUC2	YIL162W	1599 nt		3.7	□□□□□ -1.82
SYF1	Q04048	ENA2	YDR039C	3276 nt		3.7	□□□□□ -1.82
SYF1	Q04048	ENA1	YDR040C	3276 nt		3.7	□□□□□ -1.82
SYF1	Q04048	CHO2	YGR157W	2610 nt		3.7	□□□□□ -1.82
SYF1	Q04048	YHR080C	YHR080C	4038 nt		3.69	□□□□□ -1.82
SYF1	Q04048	PKP2	YGL059W	1476 nt		3.69	□□□□□ -1.82
SYF1	Q04048	YLR352W	YLR352W	2424 nt		3.69	□□□□□ -1.82
SYF1	Q04048	YJR030C	YJR030C	2238 nt		3.69	□□□□□ -1.82
SYF1	Q04048	YEL057C	YEL057C	702 nt		3.69	□□□□□ -1.82
SYF1	Q04048	HMF1	YER057C	390 nt		3.69	□□□□□ -1.82
SYF1	Q04048	RPL1B	YGL135W	654 nt		3.69	□□□□□ -1.82
SYF1	Q04048	tQ(UUG)B	tQ(UUG)B	72 nt		3.69	□□□□□ -1.82
SYF1	Q04048	DOG2	YHR043C	741 nt		3.69	□□□□□ -1.82
SYF1	Q04048	MMF1	YIL051C	438 nt		3.69	□□□□□ -1.82
SYF1	Q04048	PEX11	YOL147C	711 nt		3.69	□□□□□ -1.82
SYF1	Q04048	RRP36	YOR287C	903 nt		3.69	□□□□□ -1.82
SYF1	Q04048	RPL1A	YPL220W	654 nt		3.69	□□□□□ -1.82
SYF1	Q04048	ARO4	YBR249C	1113 nt		3.69	□□□□□ -1.82
SYF1	Q04048	HRD1	YOL013C	1656 nt		3.68	□□□□□ -1.82
SYF1	Q04048	RPA190	YOR341W	4995 nt		3.68	□□□□□ -1.82
SYF1	Q04048	YGR114C	YGR114C	390 nt		3.68	□□□□□ -1.82
SYF1	Q04048	TDA10	YGR205W	873 nt		3.68	□□□□□ -1.82
SYF1	Q04048	MET14	YKL001C	609 nt		3.68	□□□□□ -1.82
SYF1	Q04048	BOS1	YLR078C	735 nt		3.68	□□□□□ -1.82
SYF1	Q04048	HHF1	YBR009C	312 nt		3.68	□□□□□ -1.82
SYF1	Q04048	YPR077C	YPR077C	372 nt		3.68	□□□□□ -1.82
SYF1	Q04048	SKN7	YHR206W	1869 nt		3.68	□□□□□ -1.82
SYF1	Q04048	ETP1	YHL010C	1758 nt		3.68	□□□□□ -1.82
SYF1	Q04048	STU1	YBL034C	4542 nt		3.68	□□□□□ -1.82
SYF1	Q04048	CDC40	YDR364C	1368 nt		3.67	□□□□□ -1.82
SYF1	Q04048	YKL222C	YKL222C	2118 nt		3.67	□□□□□ -1.82
SYF1	Q04048	HEF3	YNL014W	3135 nt		3.67	□□□□□ -1.82
SYF1	Q04048	DUN1	YDL101C	1542 nt		3.67	□□□□□ -1.82
SYF1	Q04048	RRP42	YDL111C	798 nt		3.67	□□□□□ -1.82
SYF1	Q04048	YHR097C	YHR097C	1101 nt		3.67	□□□□□ -1.82
SYF1	Q04048	YVH1	YIR026C	1095 nt		3.67	□□□□□ -1.82
SYF1	Q04048	IME1	YJR094C	1083 nt		3.67	□□□□□ -1.82
SYF1	Q04048	SAM37	YMR060C	984 nt		3.67	□□□□□ -1.82
SYF1	Q04048	YOR331C	YOR331C	558 nt		3.67	□□□□□ -1.82
SYF1	Q04048	PBP2	YBR233W	1242 nt		3.67	□□□□□ -1.82
SYF1	Q04048	MTL1	YGR023W	1656 nt		3.67	□□□□□ -1.82
SYF1	Q04048	VPS17	YOR132W	1656 nt		3.67	□□□□□ -1.82
SYF1	Q04048	FAA2	YER015W	2235 nt		3.67	□□□□□ -1.82
SYF1	Q04048	ECM21	YBL101C	3354 nt		3.66	□□□□□ -1.82
SYF1	Q04048	WHI3	YNL197C	1986 nt		3.66	□□□□□ -1.82
SYF1	Q04048	PSF1	YDR013W	627 nt		3.66	□□□□□ -1.82
SYF1	Q04048	GRX2	YDR513W	432 nt		3.66	□□□□□ -1.82
SYF1	Q04048	SPT4	YGR063C	309 nt		3.66	□□□□□ -1.82
SYF1	Q04048	YGR270C-A	YGR270C-A	219 nt		3.66	□□□□□ -1.82
SYF1	Q04048	YGR237C	YGR237C	2358 nt		3.66	□□□□□ -1.82
SYF1	Q04048	PEX1	YKL197C	3132 nt		3.66	□□□□□ -1.82
SYF1	Q04048	VPS9	YML097C	1356 nt		3.65	□□□□□ -1.82
SYF1	Q04048	MDM1	YML104C	3384 nt		3.65	□□□□□ -1.82
SYF1	Q04048	BI3	Q0115	1554 nt		3.65	□□□□□ -1.82
SYF1	Q04048	SPH1	YLR313C	1593 nt		3.65	□□□□□ -1.82
SYF1	Q04048	ARP9	YMR033W	1404 nt		3.65	□□□□□ -1.83
SYF1	Q04048	UBC9	YDL064W	474 nt		3.65	□□□□□ -1.83
SYF1	Q04048	MGT1	YDL200C	567 nt		3.65	□□□□□ -1.83
SYF1	Q04048	YDR320W-B	YDR320W-B	138 nt		3.65	□□□□□ -1.83
SYF1	Q04048	tR(UCU)Q1	tR(UCU)Q1	73 nt		3.65	□□□□□ -1.83
SYF1	Q04048	RPF2	YKR081C	1035 nt		3.65	□□□□□ -1.83
SYF1	Q04048	COQ9	YLR201C	783 nt		3.65	□□□□□ -1.83
SYF1	Q04048	YDL176W	YDL176W	2127 nt		3.65	□□□□□ -1.83
SYF1	Q04048	RGC1	YPR115W	3252 nt		3.65	□□□□□ -1.83
SYF1	Q04048	MDM10	YAL010C	1482 nt		3.65	□□□□□ -1.83
SYF1	Q04048	ERG9	YHR190W	1335 nt		3.65	□□□□□ -1.83
SYF1	Q04048	EMP70	YLR083C	2004 nt		3.65	□□□□□ -1.83
SYF1	Q04048	SET1	YHR119W	3243 nt		3.65	□□□□□ -1.83
SYF1	Q04048	RGI1	YER067W	486 nt		3.64	□□□□□ -1.83
SYF1	Q04048	PSF2	YJL072C	642 nt		3.64	□□□□□ -1.83
SYF1	Q04048	ALB1	YJL122W	528 nt		3.64	□□□□□ -1.83
SYF1	Q04048	ERV41	YML067C	1059 nt		3.64	□□□□□ -1.83
SYF1	Q04048	SHH3	YMR118C	591 nt		3.64	□□□□□ -1.83
SYF1	Q04048	POL30	YBR088C	777 nt		3.64	□□□□□ -1.83
SYF1	Q04048	RSE1	YML049C	4086 nt		3.64	□□□□□ -1.83
SYF1	Q04048	CHS3	YBR023C	3498 nt		3.63	□□□□□ -1.83
SYF1	Q04048	HTA1	YDR225W	399 nt		3.63	□□□□□ -1.83
SYF1	Q04048	FSH1	YHR049W	732 nt		3.63	□□□□□ -1.83
SYF1	Q04048	YHR214C-E	YHR214C-E	300 nt		3.63	□□□□□ -1.83
SYF1	Q04048	GLG2	YJL137C	1143 nt		3.63	□□□□□ -1.83
SYF1	Q04048	YAR070C	YAR070C	300 nt		3.63	□□□□□ -1.83
SYF1	Q04048	CSM3	YMR048W	954 nt		3.63	□□□□□ -1.83
SYF1	Q04048	ECM13	YBL043W	774 nt		3.63	□□□□□ -1.83

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