Protein–RNA interactions for Protein: Q03721

KCNC4, Potassium voltage-gated channel subfamily C member 4, humanhuman

Predictions only

Length 635 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNC4Q03721 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
KCNC4Q03721 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
KCNC4Q03721 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
KCNC4Q03721 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
KCNC4Q03721 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
KCNC4Q03721 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
KCNC4Q03721 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
KCNC4Q03721 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
KCNC4Q03721 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
KCNC4Q03721 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
KCNC4Q03721 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
KCNC4Q03721 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
KCNC4Q03721 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
KCNC4Q03721 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
KCNC4Q03721 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
KCNC4Q03721 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
KCNC4Q03721 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
KCNC4Q03721 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
KCNC4Q03721 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
KCNC4Q03721 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
KCNC4Q03721 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
KCNC4Q03721 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
KCNC4Q03721 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
KCNC4Q03721 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
KCNC4Q03721 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
KCNC4Q03721 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
KCNC4Q03721 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
KCNC4Q03721 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
KCNC4Q03721 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
KCNC4Q03721 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
KCNC4Q03721 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
KCNC4Q03721 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
KCNC4Q03721 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
KCNC4Q03721 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC20.37■□□□□ 0.85
KCNC4Q03721 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
KCNC4Q03721 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
KCNC4Q03721 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
KCNC4Q03721 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
KCNC4Q03721 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
KCNC4Q03721 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
KCNC4Q03721 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
KCNC4Q03721 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
KCNC4Q03721 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
KCNC4Q03721 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
KCNC4Q03721 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
KCNC4Q03721 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
KCNC4Q03721 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
KCNC4Q03721 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
KCNC4Q03721 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
KCNC4Q03721 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
KCNC4Q03721 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
KCNC4Q03721 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
KCNC4Q03721 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
KCNC4Q03721 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
KCNC4Q03721 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
KCNC4Q03721 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
KCNC4Q03721 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
KCNC4Q03721 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
KCNC4Q03721 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
KCNC4Q03721 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
KCNC4Q03721 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
KCNC4Q03721 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
KCNC4Q03721 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
KCNC4Q03721 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
KCNC4Q03721 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
KCNC4Q03721 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
KCNC4Q03721 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
KCNC4Q03721 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
KCNC4Q03721 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
KCNC4Q03721 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
KCNC4Q03721 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
KCNC4Q03721 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
KCNC4Q03721 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
KCNC4Q03721 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
KCNC4Q03721 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
KCNC4Q03721 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
KCNC4Q03721 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
KCNC4Q03721 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
KCNC4Q03721 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
KCNC4Q03721 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
KCNC4Q03721 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
KCNC4Q03721 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
KCNC4Q03721 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
KCNC4Q03721 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
KCNC4Q03721 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
KCNC4Q03721 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
KCNC4Q03721 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
KCNC4Q03721 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
KCNC4Q03721 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
KCNC4Q03721 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
KCNC4Q03721 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
KCNC4Q03721 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
KCNC4Q03721 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
KCNC4Q03721 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
KCNC4Q03721 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
KCNC4Q03721 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
KCNC4Q03721 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
KCNC4Q03721 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
KCNC4Q03721 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
KCNC4Q03721 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.6 ms