Protein–RNA interactions for Protein: Q03188

CENPC, Centromere protein C, humanhuman

Predictions only

Length 943 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPCQ03188 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CENPCQ03188 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
CENPCQ03188 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CENPCQ03188 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CENPCQ03188 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CENPCQ03188 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
CENPCQ03188 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CENPCQ03188 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CENPCQ03188 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CENPCQ03188 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CENPCQ03188 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CENPCQ03188 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CENPCQ03188 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CENPCQ03188 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CENPCQ03188 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CENPCQ03188 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
CENPCQ03188 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CENPCQ03188 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CENPCQ03188 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CENPCQ03188 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CENPCQ03188 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CENPCQ03188 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CENPCQ03188 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CENPCQ03188 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CENPCQ03188 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CENPCQ03188 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CENPCQ03188 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CENPCQ03188 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CENPCQ03188 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CENPCQ03188 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CENPCQ03188 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CENPCQ03188 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CENPCQ03188 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CENPCQ03188 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CENPCQ03188 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CENPCQ03188 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CENPCQ03188 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CENPCQ03188 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CENPCQ03188 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CENPCQ03188 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CENPCQ03188 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CENPCQ03188 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CENPCQ03188 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CENPCQ03188 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CENPCQ03188 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CENPCQ03188 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CENPCQ03188 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CENPCQ03188 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CENPCQ03188 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CENPCQ03188 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CENPCQ03188 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CENPCQ03188 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CENPCQ03188 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CENPCQ03188 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CENPCQ03188 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CENPCQ03188 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CENPCQ03188 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CENPCQ03188 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CENPCQ03188 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CENPCQ03188 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CENPCQ03188 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CENPCQ03188 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CENPCQ03188 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CENPCQ03188 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CENPCQ03188 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CENPCQ03188 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CENPCQ03188 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CENPCQ03188 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CENPCQ03188 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CENPCQ03188 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
CENPCQ03188 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CENPCQ03188 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CENPCQ03188 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CENPCQ03188 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CENPCQ03188 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CENPCQ03188 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CENPCQ03188 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
CENPCQ03188 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CENPCQ03188 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CENPCQ03188 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CENPCQ03188 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CENPCQ03188 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CENPCQ03188 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CENPCQ03188 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CENPCQ03188 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CENPCQ03188 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CENPCQ03188 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CENPCQ03188 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CENPCQ03188 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CENPCQ03188 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CENPCQ03188 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CENPCQ03188 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CENPCQ03188 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CENPCQ03188 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CENPCQ03188 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CENPCQ03188 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CENPCQ03188 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CENPCQ03188 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
CENPCQ03188 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CENPCQ03188 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.3 ms