Protein–RNA interactions for Protein: Q00975

CACNA1B, Voltage-dependent N-type calcium channel subunit alpha-1B, humanhuman

Predictions only

Length 2,339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1BQ00975 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CACNA1BQ00975 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CACNA1BQ00975 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
CACNA1BQ00975 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CACNA1BQ00975 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CACNA1BQ00975 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CACNA1BQ00975 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CACNA1BQ00975 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CACNA1BQ00975 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CACNA1BQ00975 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CACNA1BQ00975 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
CACNA1BQ00975 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CACNA1BQ00975 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CACNA1BQ00975 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CACNA1BQ00975 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CACNA1BQ00975 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CACNA1BQ00975 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CACNA1BQ00975 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CACNA1BQ00975 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CACNA1BQ00975 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CACNA1BQ00975 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CACNA1BQ00975 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CACNA1BQ00975 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CACNA1BQ00975 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CACNA1BQ00975 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CACNA1BQ00975 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CACNA1BQ00975 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CACNA1BQ00975 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CACNA1BQ00975 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
CACNA1BQ00975 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CACNA1BQ00975 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CACNA1BQ00975 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CACNA1BQ00975 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CACNA1BQ00975 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CACNA1BQ00975 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CACNA1BQ00975 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CACNA1BQ00975 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CACNA1BQ00975 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CACNA1BQ00975 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CACNA1BQ00975 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CACNA1BQ00975 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CACNA1BQ00975 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CACNA1BQ00975 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CACNA1BQ00975 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CACNA1BQ00975 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CACNA1BQ00975 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CACNA1BQ00975 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
CACNA1BQ00975 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CACNA1BQ00975 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CACNA1BQ00975 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CACNA1BQ00975 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
CACNA1BQ00975 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CACNA1BQ00975 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CACNA1BQ00975 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
CACNA1BQ00975 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
CACNA1BQ00975 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CACNA1BQ00975 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CACNA1BQ00975 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
CACNA1BQ00975 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC19.84■□□□□ 0.77
CACNA1BQ00975 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
CACNA1BQ00975 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
CACNA1BQ00975 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
CACNA1BQ00975 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CACNA1BQ00975 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CACNA1BQ00975 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
CACNA1BQ00975 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CACNA1BQ00975 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CACNA1BQ00975 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
CACNA1BQ00975 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CACNA1BQ00975 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
CACNA1BQ00975 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
CACNA1BQ00975 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC19.83■□□□□ 0.77
CACNA1BQ00975 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
CACNA1BQ00975 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
CACNA1BQ00975 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
CACNA1BQ00975 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
CACNA1BQ00975 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.76
CACNA1BQ00975 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
CACNA1BQ00975 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
CACNA1BQ00975 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
CACNA1BQ00975 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
CACNA1BQ00975 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
CACNA1BQ00975 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC19.82■□□□□ 0.76
CACNA1BQ00975 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
CACNA1BQ00975 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC19.82■□□□□ 0.76
CACNA1BQ00975 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
CACNA1BQ00975 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
CACNA1BQ00975 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC19.82■□□□□ 0.76
CACNA1BQ00975 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC19.82■□□□□ 0.76
CACNA1BQ00975 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
CACNA1BQ00975 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC19.82■□□□□ 0.76
CACNA1BQ00975 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC19.82■□□□□ 0.76
CACNA1BQ00975 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC19.82■□□□□ 0.76
CACNA1BQ00975 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
CACNA1BQ00975 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
CACNA1BQ00975 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
CACNA1BQ00975 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
CACNA1BQ00975 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
CACNA1BQ00975 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
CACNA1BQ00975 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms