Protein–RNA interactions for Protein: Q00537

CDK17, Cyclin-dependent kinase 17, humanhuman

Predictions only

Length 523 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK17Q00537 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CDK17Q00537 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CDK17Q00537 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CDK17Q00537 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CDK17Q00537 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
CDK17Q00537 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CDK17Q00537 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CDK17Q00537 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CDK17Q00537 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CDK17Q00537 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CDK17Q00537 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
CDK17Q00537 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CDK17Q00537 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CDK17Q00537 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CDK17Q00537 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CDK17Q00537 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CDK17Q00537 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CDK17Q00537 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CDK17Q00537 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CDK17Q00537 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CDK17Q00537 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CDK17Q00537 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CDK17Q00537 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CDK17Q00537 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CDK17Q00537 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
CDK17Q00537 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CDK17Q00537 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
CDK17Q00537 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CDK17Q00537 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CDK17Q00537 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CDK17Q00537 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
CDK17Q00537 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CDK17Q00537 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CDK17Q00537 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CDK17Q00537 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
CDK17Q00537 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
CDK17Q00537 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CDK17Q00537 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CDK17Q00537 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CDK17Q00537 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CDK17Q00537 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CDK17Q00537 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CDK17Q00537 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
CDK17Q00537 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CDK17Q00537 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CDK17Q00537 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CDK17Q00537 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CDK17Q00537 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CDK17Q00537 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CDK17Q00537 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CDK17Q00537 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CDK17Q00537 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CDK17Q00537 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CDK17Q00537 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CDK17Q00537 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CDK17Q00537 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CDK17Q00537 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CDK17Q00537 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CDK17Q00537 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
CDK17Q00537 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CDK17Q00537 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
CDK17Q00537 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CDK17Q00537 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CDK17Q00537 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CDK17Q00537 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CDK17Q00537 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
CDK17Q00537 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CDK17Q00537 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CDK17Q00537 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CDK17Q00537 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
CDK17Q00537 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CDK17Q00537 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CDK17Q00537 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CDK17Q00537 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CDK17Q00537 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CDK17Q00537 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CDK17Q00537 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CDK17Q00537 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CDK17Q00537 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CDK17Q00537 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CDK17Q00537 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CDK17Q00537 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CDK17Q00537 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CDK17Q00537 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CDK17Q00537 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CDK17Q00537 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CDK17Q00537 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CDK17Q00537 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CDK17Q00537 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CDK17Q00537 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CDK17Q00537 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CDK17Q00537 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CDK17Q00537 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CDK17Q00537 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CDK17Q00537 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CDK17Q00537 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CDK17Q00537 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CDK17Q00537 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CDK17Q00537 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CDK17Q00537 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.4 ms