Protein–RNA interactions for Protein: Q00341

HDLBP, Vigilin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,268 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDLBPQ00341 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
HDLBPQ00341 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
HDLBPQ00341 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
HDLBPQ00341 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
HDLBPQ00341 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
HDLBPQ00341 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
HDLBPQ00341 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
HDLBPQ00341 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
HDLBPQ00341 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC25.42■■□□□ 1.66
HDLBPQ00341 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
HDLBPQ00341 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
HDLBPQ00341 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
HDLBPQ00341 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
HDLBPQ00341 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
HDLBPQ00341 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
HDLBPQ00341 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC25.41■■□□□ 1.66
HDLBPQ00341 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
HDLBPQ00341 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
HDLBPQ00341 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
HDLBPQ00341 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
HDLBPQ00341 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
HDLBPQ00341 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
HDLBPQ00341 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
HDLBPQ00341 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
HDLBPQ00341 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
HDLBPQ00341 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
HDLBPQ00341 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
HDLBPQ00341 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
HDLBPQ00341 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
HDLBPQ00341 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
HDLBPQ00341 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC25.39■■□□□ 1.66
HDLBPQ00341 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
HDLBPQ00341 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
HDLBPQ00341 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
HDLBPQ00341 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.66
HDLBPQ00341 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
HDLBPQ00341 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
HDLBPQ00341 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
HDLBPQ00341 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
HDLBPQ00341 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
HDLBPQ00341 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
HDLBPQ00341 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
HDLBPQ00341 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
HDLBPQ00341 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
HDLBPQ00341 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
HDLBPQ00341 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
HDLBPQ00341 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
HDLBPQ00341 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
HDLBPQ00341 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
HDLBPQ00341 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
HDLBPQ00341 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
HDLBPQ00341 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
HDLBPQ00341 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
HDLBPQ00341 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
HDLBPQ00341 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
HDLBPQ00341 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
HDLBPQ00341 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
HDLBPQ00341 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
HDLBPQ00341 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
HDLBPQ00341 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
HDLBPQ00341 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
HDLBPQ00341 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
HDLBPQ00341 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
HDLBPQ00341 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
HDLBPQ00341 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
HDLBPQ00341 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC25.36■■□□□ 1.65
HDLBPQ00341 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
HDLBPQ00341 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
HDLBPQ00341 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
HDLBPQ00341 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
HDLBPQ00341 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
HDLBPQ00341 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
HDLBPQ00341 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
HDLBPQ00341 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
HDLBPQ00341 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
HDLBPQ00341 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
HDLBPQ00341 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
HDLBPQ00341 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
HDLBPQ00341 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
HDLBPQ00341 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
HDLBPQ00341 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
HDLBPQ00341 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
HDLBPQ00341 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
HDLBPQ00341 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
HDLBPQ00341 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
HDLBPQ00341 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
HDLBPQ00341 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
HDLBPQ00341 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
HDLBPQ00341 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC25.34■■□□□ 1.65
HDLBPQ00341 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
HDLBPQ00341 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
HDLBPQ00341 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
HDLBPQ00341 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
HDLBPQ00341 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
HDLBPQ00341 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
HDLBPQ00341 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
HDLBPQ00341 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
HDLBPQ00341 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
HDLBPQ00341 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
HDLBPQ00341 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms