Protein–RNA interactions for Protein: P98172

EFNB1, Ephrin-B1, humanhuman

Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFNB1P98172 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
EFNB1P98172 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
EFNB1P98172 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
EFNB1P98172 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
EFNB1P98172 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
EFNB1P98172 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.63
EFNB1P98172 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
EFNB1P98172 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
EFNB1P98172 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
EFNB1P98172 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
EFNB1P98172 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
EFNB1P98172 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
EFNB1P98172 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
EFNB1P98172 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
EFNB1P98172 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
EFNB1P98172 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
EFNB1P98172 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
EFNB1P98172 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
EFNB1P98172 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
EFNB1P98172 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
EFNB1P98172 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
EFNB1P98172 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
EFNB1P98172 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
EFNB1P98172 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
EFNB1P98172 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
EFNB1P98172 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
EFNB1P98172 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
EFNB1P98172 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
EFNB1P98172 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC19■□□□□ 0.63
EFNB1P98172 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
EFNB1P98172 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
EFNB1P98172 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
EFNB1P98172 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
EFNB1P98172 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
EFNB1P98172 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
EFNB1P98172 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC19■□□□□ 0.63
EFNB1P98172 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
EFNB1P98172 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
EFNB1P98172 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
EFNB1P98172 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
EFNB1P98172 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
EFNB1P98172 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
EFNB1P98172 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
EFNB1P98172 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
EFNB1P98172 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
EFNB1P98172 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
EFNB1P98172 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
EFNB1P98172 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
EFNB1P98172 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
EFNB1P98172 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
EFNB1P98172 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
EFNB1P98172 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
EFNB1P98172 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
EFNB1P98172 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
EFNB1P98172 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
EFNB1P98172 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
EFNB1P98172 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
EFNB1P98172 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
EFNB1P98172 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
EFNB1P98172 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
EFNB1P98172 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
EFNB1P98172 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
EFNB1P98172 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
EFNB1P98172 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
EFNB1P98172 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
EFNB1P98172 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
EFNB1P98172 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
EFNB1P98172 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
EFNB1P98172 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
EFNB1P98172 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
EFNB1P98172 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
EFNB1P98172 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
EFNB1P98172 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
EFNB1P98172 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
EFNB1P98172 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
EFNB1P98172 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
EFNB1P98172 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
EFNB1P98172 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
EFNB1P98172 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
EFNB1P98172 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
EFNB1P98172 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
EFNB1P98172 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
EFNB1P98172 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
EFNB1P98172 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
EFNB1P98172 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
EFNB1P98172 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
EFNB1P98172 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
EFNB1P98172 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
EFNB1P98172 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
EFNB1P98172 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
EFNB1P98172 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
EFNB1P98172 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
EFNB1P98172 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
EFNB1P98172 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
EFNB1P98172 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
EFNB1P98172 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
EFNB1P98172 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
EFNB1P98172 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
EFNB1P98172 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
EFNB1P98172 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.5 ms