Protein–RNA interactions for Protein: P83105

HTRA4, Serine protease HTRA4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 476 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTRA4P83105 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
HTRA4P83105 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
HTRA4P83105 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
HTRA4P83105 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
HTRA4P83105 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
HTRA4P83105 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
HTRA4P83105 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
HTRA4P83105 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
HTRA4P83105 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
HTRA4P83105 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
HTRA4P83105 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
HTRA4P83105 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
HTRA4P83105 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
HTRA4P83105 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
HTRA4P83105 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
HTRA4P83105 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
HTRA4P83105 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
HTRA4P83105 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
HTRA4P83105 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
HTRA4P83105 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
HTRA4P83105 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
HTRA4P83105 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
HTRA4P83105 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
HTRA4P83105 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
HTRA4P83105 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
HTRA4P83105 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
HTRA4P83105 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
HTRA4P83105 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
HTRA4P83105 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
HTRA4P83105 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
HTRA4P83105 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
HTRA4P83105 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
HTRA4P83105 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
HTRA4P83105 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
HTRA4P83105 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
HTRA4P83105 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
HTRA4P83105 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC22.77■■□□□ 1.24
HTRA4P83105 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
HTRA4P83105 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
HTRA4P83105 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
HTRA4P83105 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
HTRA4P83105 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
HTRA4P83105 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
HTRA4P83105 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
HTRA4P83105 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
HTRA4P83105 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
HTRA4P83105 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
HTRA4P83105 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
HTRA4P83105 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
HTRA4P83105 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
HTRA4P83105 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
HTRA4P83105 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
HTRA4P83105 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
HTRA4P83105 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
HTRA4P83105 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
HTRA4P83105 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
HTRA4P83105 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
HTRA4P83105 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
HTRA4P83105 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
HTRA4P83105 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
HTRA4P83105 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
HTRA4P83105 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
HTRA4P83105 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
HTRA4P83105 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
HTRA4P83105 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
HTRA4P83105 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
HTRA4P83105 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
HTRA4P83105 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
HTRA4P83105 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
HTRA4P83105 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
HTRA4P83105 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
HTRA4P83105 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
HTRA4P83105 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
HTRA4P83105 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
HTRA4P83105 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
HTRA4P83105 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
HTRA4P83105 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
HTRA4P83105 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
HTRA4P83105 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
HTRA4P83105 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
HTRA4P83105 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
HTRA4P83105 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
HTRA4P83105 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
HTRA4P83105 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
HTRA4P83105 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
HTRA4P83105 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
HTRA4P83105 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
HTRA4P83105 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
HTRA4P83105 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
HTRA4P83105 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
HTRA4P83105 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
HTRA4P83105 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
HTRA4P83105 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
HTRA4P83105 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
HTRA4P83105 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
HTRA4P83105 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
HTRA4P83105 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
HTRA4P83105 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
HTRA4P83105 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
HTRA4P83105 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.9 ms