Protein–RNA interactions for Protein: P82980

RBP5, Retinol-binding protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 135 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBP5P82980 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RBP5P82980 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RBP5P82980 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RBP5P82980 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RBP5P82980 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RBP5P82980 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RBP5P82980 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RBP5P82980 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RBP5P82980 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RBP5P82980 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RBP5P82980 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RBP5P82980 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RBP5P82980 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
RBP5P82980 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RBP5P82980 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RBP5P82980 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RBP5P82980 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RBP5P82980 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
RBP5P82980 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RBP5P82980 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RBP5P82980 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
RBP5P82980 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RBP5P82980 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RBP5P82980 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RBP5P82980 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RBP5P82980 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RBP5P82980 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RBP5P82980 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RBP5P82980 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
RBP5P82980 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RBP5P82980 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RBP5P82980 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RBP5P82980 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RBP5P82980 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RBP5P82980 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RBP5P82980 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RBP5P82980 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RBP5P82980 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RBP5P82980 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RBP5P82980 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
RBP5P82980 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RBP5P82980 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RBP5P82980 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RBP5P82980 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RBP5P82980 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RBP5P82980 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RBP5P82980 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RBP5P82980 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RBP5P82980 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RBP5P82980 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RBP5P82980 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RBP5P82980 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RBP5P82980 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
RBP5P82980 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RBP5P82980 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RBP5P82980 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RBP5P82980 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RBP5P82980 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RBP5P82980 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RBP5P82980 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RBP5P82980 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RBP5P82980 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RBP5P82980 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RBP5P82980 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RBP5P82980 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RBP5P82980 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RBP5P82980 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
RBP5P82980 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RBP5P82980 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
RBP5P82980 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
RBP5P82980 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RBP5P82980 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RBP5P82980 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RBP5P82980 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RBP5P82980 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RBP5P82980 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RBP5P82980 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RBP5P82980 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RBP5P82980 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RBP5P82980 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RBP5P82980 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RBP5P82980 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RBP5P82980 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RBP5P82980 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RBP5P82980 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RBP5P82980 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RBP5P82980 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RBP5P82980 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RBP5P82980 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RBP5P82980 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RBP5P82980 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RBP5P82980 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RBP5P82980 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RBP5P82980 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RBP5P82980 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RBP5P82980 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RBP5P82980 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RBP5P82980 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RBP5P82980 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RBP5P82980 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms