Protein–RNA interactions for Protein: P82279

CRB1, Protein crumbs homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRB1P82279 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
CRB1P82279 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
CRB1P82279 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
CRB1P82279 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
CRB1P82279 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
CRB1P82279 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
CRB1P82279 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
CRB1P82279 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
CRB1P82279 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
CRB1P82279 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
CRB1P82279 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC28.43■■■□□ 2.14
CRB1P82279 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
CRB1P82279 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
CRB1P82279 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC28.43■■■□□ 2.14
CRB1P82279 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC28.43■■■□□ 2.14
CRB1P82279 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
CRB1P82279 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
CRB1P82279 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
CRB1P82279 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
CRB1P82279 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
CRB1P82279 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
CRB1P82279 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
CRB1P82279 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
CRB1P82279 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
CRB1P82279 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
CRB1P82279 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC28.42■■■□□ 2.14
CRB1P82279 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
CRB1P82279 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
CRB1P82279 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
CRB1P82279 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
CRB1P82279 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
CRB1P82279 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
CRB1P82279 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
CRB1P82279 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
CRB1P82279 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC28.41■■■□□ 2.14
CRB1P82279 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
CRB1P82279 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
CRB1P82279 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
CRB1P82279 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
CRB1P82279 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
CRB1P82279 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
CRB1P82279 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
CRB1P82279 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
CRB1P82279 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
CRB1P82279 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
CRB1P82279 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
CRB1P82279 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
CRB1P82279 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC28.4■■■□□ 2.14
CRB1P82279 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
CRB1P82279 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
CRB1P82279 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
CRB1P82279 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
CRB1P82279 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
CRB1P82279 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
CRB1P82279 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
CRB1P82279 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
CRB1P82279 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
CRB1P82279 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
CRB1P82279 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
CRB1P82279 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
CRB1P82279 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
CRB1P82279 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
CRB1P82279 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
CRB1P82279 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
CRB1P82279 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
CRB1P82279 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
CRB1P82279 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC28.39■■■□□ 2.13
CRB1P82279 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
CRB1P82279 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC28.38■■■□□ 2.13
CRB1P82279 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
CRB1P82279 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
CRB1P82279 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC28.38■■■□□ 2.13
CRB1P82279 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC28.38■■■□□ 2.13
CRB1P82279 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
CRB1P82279 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
CRB1P82279 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
CRB1P82279 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
CRB1P82279 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
CRB1P82279 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
CRB1P82279 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
CRB1P82279 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
CRB1P82279 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
CRB1P82279 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
CRB1P82279 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
CRB1P82279 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
CRB1P82279 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
CRB1P82279 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
CRB1P82279 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
CRB1P82279 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
CRB1P82279 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC28.36■■■□□ 2.13
CRB1P82279 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
CRB1P82279 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
CRB1P82279 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
CRB1P82279 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC28.36■■■□□ 2.13
CRB1P82279 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
CRB1P82279 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
CRB1P82279 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
CRB1P82279 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
CRB1P82279 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
CRB1P82279 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC28.35■■■□□ 2.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms