Protein–RNA interactions for Protein: P80217

IFI35, Interferon-induced 35 kDa protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 286 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFI35P80217 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
IFI35P80217 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
IFI35P80217 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
IFI35P80217 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
IFI35P80217 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
IFI35P80217 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
IFI35P80217 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
IFI35P80217 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
IFI35P80217 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
IFI35P80217 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC22■■□□□ 1.11
IFI35P80217 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
IFI35P80217 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
IFI35P80217 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
IFI35P80217 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC22■■□□□ 1.11
IFI35P80217 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC22■■□□□ 1.11
IFI35P80217 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
IFI35P80217 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
IFI35P80217 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
IFI35P80217 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
IFI35P80217 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
IFI35P80217 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
IFI35P80217 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
IFI35P80217 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
IFI35P80217 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
IFI35P80217 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
IFI35P80217 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
IFI35P80217 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
IFI35P80217 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
IFI35P80217 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
IFI35P80217 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
IFI35P80217 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
IFI35P80217 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
IFI35P80217 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
IFI35P80217 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
IFI35P80217 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
IFI35P80217 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
IFI35P80217 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
IFI35P80217 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
IFI35P80217 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
IFI35P80217 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
IFI35P80217 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
IFI35P80217 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
IFI35P80217 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
IFI35P80217 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
IFI35P80217 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
IFI35P80217 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
IFI35P80217 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
IFI35P80217 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
IFI35P80217 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
IFI35P80217 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
IFI35P80217 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
IFI35P80217 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
IFI35P80217 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
IFI35P80217 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
IFI35P80217 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
IFI35P80217 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
IFI35P80217 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
IFI35P80217 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
IFI35P80217 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
IFI35P80217 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
IFI35P80217 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
IFI35P80217 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
IFI35P80217 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
IFI35P80217 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
IFI35P80217 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
IFI35P80217 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
IFI35P80217 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
IFI35P80217 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
IFI35P80217 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
IFI35P80217 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
IFI35P80217 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
IFI35P80217 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
IFI35P80217 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
IFI35P80217 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
IFI35P80217 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
IFI35P80217 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
IFI35P80217 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
IFI35P80217 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
IFI35P80217 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
IFI35P80217 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
IFI35P80217 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
IFI35P80217 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
IFI35P80217 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
IFI35P80217 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
IFI35P80217 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
IFI35P80217 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
IFI35P80217 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
IFI35P80217 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
IFI35P80217 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
IFI35P80217 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
IFI35P80217 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
IFI35P80217 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
IFI35P80217 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC21.94■■□□□ 1.1
IFI35P80217 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
IFI35P80217 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
IFI35P80217 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
IFI35P80217 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
IFI35P80217 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
IFI35P80217 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
IFI35P80217 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.5 ms