Protein–RNA interactions for Protein: P78348

ASIC1, Acid-sensing ion channel 1, humanhuman

Predictions only

Length 528 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ASIC1P78348 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ASIC1P78348 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ASIC1P78348 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
ASIC1P78348 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
ASIC1P78348 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
ASIC1P78348 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
ASIC1P78348 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ASIC1P78348 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ASIC1P78348 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
ASIC1P78348 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ASIC1P78348 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ASIC1P78348 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
ASIC1P78348 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
ASIC1P78348 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC23.64■■□□□ 1.38
ASIC1P78348 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
ASIC1P78348 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
ASIC1P78348 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
ASIC1P78348 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
ASIC1P78348 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
ASIC1P78348 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
ASIC1P78348 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
ASIC1P78348 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
ASIC1P78348 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
ASIC1P78348 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
ASIC1P78348 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
ASIC1P78348 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
ASIC1P78348 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
ASIC1P78348 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
ASIC1P78348 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
ASIC1P78348 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
ASIC1P78348 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ASIC1P78348 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ASIC1P78348 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ASIC1P78348 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ASIC1P78348 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ASIC1P78348 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ASIC1P78348 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ASIC1P78348 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ASIC1P78348 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ASIC1P78348 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ASIC1P78348 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ASIC1P78348 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ASIC1P78348 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ASIC1P78348 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ASIC1P78348 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ASIC1P78348 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ASIC1P78348 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ASIC1P78348 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ASIC1P78348 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ASIC1P78348 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ASIC1P78348 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ASIC1P78348 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ASIC1P78348 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ASIC1P78348 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ASIC1P78348 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ASIC1P78348 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ASIC1P78348 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ASIC1P78348 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
ASIC1P78348 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ASIC1P78348 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ASIC1P78348 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ASIC1P78348 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ASIC1P78348 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
ASIC1P78348 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
ASIC1P78348 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ASIC1P78348 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ASIC1P78348 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ASIC1P78348 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ASIC1P78348 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ASIC1P78348 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ASIC1P78348 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ASIC1P78348 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ASIC1P78348 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ASIC1P78348 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ASIC1P78348 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ASIC1P78348 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ASIC1P78348 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ASIC1P78348 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
ASIC1P78348 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ASIC1P78348 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ASIC1P78348 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
ASIC1P78348 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ASIC1P78348 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ASIC1P78348 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ASIC1P78348 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ASIC1P78348 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ASIC1P78348 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ASIC1P78348 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ASIC1P78348 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ASIC1P78348 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ASIC1P78348 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ASIC1P78348 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ASIC1P78348 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ASIC1P78348 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
ASIC1P78348 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ASIC1P78348 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ASIC1P78348 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ASIC1P78348 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ASIC1P78348 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ASIC1P78348 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.9 ms