Protein–RNA interactions for Protein: P63261

ACTG1, Actin, cytoplasmic 2, humanhuman

Predictions only

Length 375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTG1P63261 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ACTG1P63261 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ACTG1P63261 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ACTG1P63261 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ACTG1P63261 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ACTG1P63261 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ACTG1P63261 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ACTG1P63261 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ACTG1P63261 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ACTG1P63261 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ACTG1P63261 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ACTG1P63261 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ACTG1P63261 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ACTG1P63261 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ACTG1P63261 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ACTG1P63261 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ACTG1P63261 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ACTG1P63261 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ACTG1P63261 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ACTG1P63261 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ACTG1P63261 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ACTG1P63261 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ACTG1P63261 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ACTG1P63261 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ACTG1P63261 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ACTG1P63261 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ACTG1P63261 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ACTG1P63261 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
ACTG1P63261 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ACTG1P63261 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
ACTG1P63261 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ACTG1P63261 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ACTG1P63261 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ACTG1P63261 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
ACTG1P63261 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ACTG1P63261 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ACTG1P63261 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ACTG1P63261 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ACTG1P63261 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ACTG1P63261 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ACTG1P63261 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ACTG1P63261 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ACTG1P63261 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ACTG1P63261 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ACTG1P63261 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ACTG1P63261 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ACTG1P63261 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ACTG1P63261 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ACTG1P63261 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ACTG1P63261 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ACTG1P63261 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ACTG1P63261 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ACTG1P63261 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.54
ACTG1P63261 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ACTG1P63261 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ACTG1P63261 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ACTG1P63261 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ACTG1P63261 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ACTG1P63261 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
ACTG1P63261 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ACTG1P63261 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ACTG1P63261 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
ACTG1P63261 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ACTG1P63261 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ACTG1P63261 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ACTG1P63261 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ACTG1P63261 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ACTG1P63261 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ACTG1P63261 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ACTG1P63261 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ACTG1P63261 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ACTG1P63261 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ACTG1P63261 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ACTG1P63261 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ACTG1P63261 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ACTG1P63261 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ACTG1P63261 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ACTG1P63261 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ACTG1P63261 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ACTG1P63261 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ACTG1P63261 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ACTG1P63261 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
ACTG1P63261 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ACTG1P63261 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ACTG1P63261 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ACTG1P63261 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ACTG1P63261 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ACTG1P63261 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ACTG1P63261 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ACTG1P63261 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ACTG1P63261 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ACTG1P63261 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ACTG1P63261 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ACTG1P63261 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ACTG1P63261 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ACTG1P63261 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ACTG1P63261 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ACTG1P63261 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ACTG1P63261 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ACTG1P63261 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.7 ms