Protein–RNA interactions for Protein: P62875

POLR2L, DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC5, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 67 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2LP62875 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
POLR2LP62875 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC21.29■■□□□ 1
POLR2LP62875 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
POLR2LP62875 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
POLR2LP62875 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
POLR2LP62875 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
POLR2LP62875 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
POLR2LP62875 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
POLR2LP62875 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC21.28■■□□□ 1
POLR2LP62875 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
POLR2LP62875 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
POLR2LP62875 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
POLR2LP62875 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC21.28■■□□□ 1
POLR2LP62875 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
POLR2LP62875 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
POLR2LP62875 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
POLR2LP62875 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
POLR2LP62875 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
POLR2LP62875 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
POLR2LP62875 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
POLR2LP62875 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
POLR2LP62875 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
POLR2LP62875 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
POLR2LP62875 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
POLR2LP62875 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
POLR2LP62875 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
POLR2LP62875 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
POLR2LP62875 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
POLR2LP62875 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
POLR2LP62875 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
POLR2LP62875 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
POLR2LP62875 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC21.27■■□□□ 1
POLR2LP62875 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
POLR2LP62875 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
POLR2LP62875 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
POLR2LP62875 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC21.27■□□□□ 0.99
POLR2LP62875 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
POLR2LP62875 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
POLR2LP62875 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
POLR2LP62875 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
POLR2LP62875 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
POLR2LP62875 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
POLR2LP62875 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
POLR2LP62875 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
POLR2LP62875 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
POLR2LP62875 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
POLR2LP62875 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
POLR2LP62875 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC21.26■□□□□ 0.99
POLR2LP62875 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
POLR2LP62875 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
POLR2LP62875 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
POLR2LP62875 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
POLR2LP62875 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
POLR2LP62875 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
POLR2LP62875 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
POLR2LP62875 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
POLR2LP62875 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
POLR2LP62875 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
POLR2LP62875 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
POLR2LP62875 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
POLR2LP62875 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
POLR2LP62875 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
POLR2LP62875 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
POLR2LP62875 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
POLR2LP62875 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
POLR2LP62875 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
POLR2LP62875 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
POLR2LP62875 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
POLR2LP62875 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
POLR2LP62875 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
POLR2LP62875 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
POLR2LP62875 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
POLR2LP62875 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
POLR2LP62875 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
POLR2LP62875 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
POLR2LP62875 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
POLR2LP62875 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
POLR2LP62875 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
POLR2LP62875 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
POLR2LP62875 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
POLR2LP62875 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
POLR2LP62875 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
POLR2LP62875 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
POLR2LP62875 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
POLR2LP62875 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
POLR2LP62875 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
POLR2LP62875 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
POLR2LP62875 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
POLR2LP62875 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
POLR2LP62875 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
POLR2LP62875 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
POLR2LP62875 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
POLR2LP62875 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
POLR2LP62875 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
POLR2LP62875 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
POLR2LP62875 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
POLR2LP62875 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
POLR2LP62875 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
POLR2LP62875 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
POLR2LP62875 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.2 ms