Protein–RNA interactions for Protein: P60608

ERVFC1-1, Endogenous retrovirus group FC1 member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 527 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVFC1-1P60608 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ERVFC1-1P60608 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
ERVFC1-1P60608 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ERVFC1-1P60608 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ERVFC1-1P60608 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ERVFC1-1P60608 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ERVFC1-1P60608 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ERVFC1-1P60608 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ERVFC1-1P60608 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ERVFC1-1P60608 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
ERVFC1-1P60608 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ERVFC1-1P60608 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ERVFC1-1P60608 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ERVFC1-1P60608 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ERVFC1-1P60608 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ERVFC1-1P60608 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ERVFC1-1P60608 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ERVFC1-1P60608 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ERVFC1-1P60608 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ERVFC1-1P60608 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ERVFC1-1P60608 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ERVFC1-1P60608 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ERVFC1-1P60608 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ERVFC1-1P60608 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ERVFC1-1P60608 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ERVFC1-1P60608 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ERVFC1-1P60608 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ERVFC1-1P60608 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
ERVFC1-1P60608 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
ERVFC1-1P60608 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ERVFC1-1P60608 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ERVFC1-1P60608 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ERVFC1-1P60608 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ERVFC1-1P60608 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ERVFC1-1P60608 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ERVFC1-1P60608 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ERVFC1-1P60608 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ERVFC1-1P60608 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ERVFC1-1P60608 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ERVFC1-1P60608 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ERVFC1-1P60608 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ERVFC1-1P60608 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ERVFC1-1P60608 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ERVFC1-1P60608 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ERVFC1-1P60608 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ERVFC1-1P60608 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
ERVFC1-1P60608 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ERVFC1-1P60608 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ERVFC1-1P60608 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ERVFC1-1P60608 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ERVFC1-1P60608 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ERVFC1-1P60608 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ERVFC1-1P60608 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ERVFC1-1P60608 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ERVFC1-1P60608 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ERVFC1-1P60608 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ERVFC1-1P60608 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ERVFC1-1P60608 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ERVFC1-1P60608 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ERVFC1-1P60608 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ERVFC1-1P60608 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ERVFC1-1P60608 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ERVFC1-1P60608 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ERVFC1-1P60608 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ERVFC1-1P60608 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ERVFC1-1P60608 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ERVFC1-1P60608 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ERVFC1-1P60608 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ERVFC1-1P60608 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ERVFC1-1P60608 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ERVFC1-1P60608 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ERVFC1-1P60608 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ERVFC1-1P60608 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ERVFC1-1P60608 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ERVFC1-1P60608 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ERVFC1-1P60608 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ERVFC1-1P60608 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ERVFC1-1P60608 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ERVFC1-1P60608 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ERVFC1-1P60608 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ERVFC1-1P60608 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ERVFC1-1P60608 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ERVFC1-1P60608 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ERVFC1-1P60608 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ERVFC1-1P60608 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ERVFC1-1P60608 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ERVFC1-1P60608 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ERVFC1-1P60608 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ERVFC1-1P60608 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ERVFC1-1P60608 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ERVFC1-1P60608 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ERVFC1-1P60608 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ERVFC1-1P60608 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ERVFC1-1P60608 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
ERVFC1-1P60608 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ERVFC1-1P60608 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ERVFC1-1P60608 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ERVFC1-1P60608 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ERVFC1-1P60608 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ERVFC1-1P60608 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms