Protein–RNA interactions for Protein: P60606

CTXN1, Cortexin-1, humanhuman

Predictions only

Length 82 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTXN1P60606 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CTXN1P60606 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
CTXN1P60606 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CTXN1P60606 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CTXN1P60606 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CTXN1P60606 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CTXN1P60606 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
CTXN1P60606 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CTXN1P60606 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CTXN1P60606 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CTXN1P60606 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CTXN1P60606 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CTXN1P60606 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CTXN1P60606 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CTXN1P60606 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CTXN1P60606 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CTXN1P60606 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CTXN1P60606 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CTXN1P60606 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CTXN1P60606 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CTXN1P60606 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
CTXN1P60606 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CTXN1P60606 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CTXN1P60606 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CTXN1P60606 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CTXN1P60606 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CTXN1P60606 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CTXN1P60606 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
CTXN1P60606 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CTXN1P60606 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CTXN1P60606 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CTXN1P60606 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CTXN1P60606 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CTXN1P60606 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CTXN1P60606 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CTXN1P60606 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CTXN1P60606 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CTXN1P60606 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CTXN1P60606 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CTXN1P60606 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CTXN1P60606 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
CTXN1P60606 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CTXN1P60606 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CTXN1P60606 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CTXN1P60606 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CTXN1P60606 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
CTXN1P60606 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CTXN1P60606 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CTXN1P60606 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CTXN1P60606 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CTXN1P60606 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CTXN1P60606 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CTXN1P60606 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CTXN1P60606 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CTXN1P60606 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CTXN1P60606 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CTXN1P60606 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CTXN1P60606 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CTXN1P60606 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CTXN1P60606 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CTXN1P60606 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CTXN1P60606 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
CTXN1P60606 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CTXN1P60606 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CTXN1P60606 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CTXN1P60606 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CTXN1P60606 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CTXN1P60606 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CTXN1P60606 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CTXN1P60606 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CTXN1P60606 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CTXN1P60606 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CTXN1P60606 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CTXN1P60606 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CTXN1P60606 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CTXN1P60606 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CTXN1P60606 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CTXN1P60606 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
CTXN1P60606 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CTXN1P60606 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CTXN1P60606 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CTXN1P60606 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CTXN1P60606 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CTXN1P60606 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CTXN1P60606 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CTXN1P60606 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CTXN1P60606 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CTXN1P60606 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CTXN1P60606 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CTXN1P60606 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
CTXN1P60606 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CTXN1P60606 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CTXN1P60606 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CTXN1P60606 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CTXN1P60606 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CTXN1P60606 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CTXN1P60606 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CTXN1P60606 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CTXN1P60606 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CTXN1P60606 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms