Protein–RNA interactions for Protein: P60509

ERVPABLB-1, Endogenous retrovirus group PABLB member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 514 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVPABLB-1P60509 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
ERVPABLB-1P60509 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
ERVPABLB-1P60509 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
ERVPABLB-1P60509 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
ERVPABLB-1P60509 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
ERVPABLB-1P60509 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
ERVPABLB-1P60509 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
ERVPABLB-1P60509 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ERVPABLB-1P60509 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
ERVPABLB-1P60509 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ERVPABLB-1P60509 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
ERVPABLB-1P60509 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ERVPABLB-1P60509 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ERVPABLB-1P60509 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ERVPABLB-1P60509 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ERVPABLB-1P60509 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
ERVPABLB-1P60509 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ERVPABLB-1P60509 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
ERVPABLB-1P60509 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
ERVPABLB-1P60509 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
ERVPABLB-1P60509 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ERVPABLB-1P60509 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ERVPABLB-1P60509 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ERVPABLB-1P60509 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
ERVPABLB-1P60509 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ERVPABLB-1P60509 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
ERVPABLB-1P60509 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ERVPABLB-1P60509 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
ERVPABLB-1P60509 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ERVPABLB-1P60509 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ERVPABLB-1P60509 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ERVPABLB-1P60509 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
ERVPABLB-1P60509 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
ERVPABLB-1P60509 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ERVPABLB-1P60509 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC21■□□□□ 0.95
ERVPABLB-1P60509 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
ERVPABLB-1P60509 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
ERVPABLB-1P60509 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
ERVPABLB-1P60509 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ERVPABLB-1P60509 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ERVPABLB-1P60509 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ERVPABLB-1P60509 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ERVPABLB-1P60509 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ERVPABLB-1P60509 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ERVPABLB-1P60509 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ERVPABLB-1P60509 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ERVPABLB-1P60509 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ERVPABLB-1P60509 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
ERVPABLB-1P60509 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
ERVPABLB-1P60509 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
ERVPABLB-1P60509 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
ERVPABLB-1P60509 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
ERVPABLB-1P60509 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ERVPABLB-1P60509 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ERVPABLB-1P60509 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
ERVPABLB-1P60509 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
ERVPABLB-1P60509 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
ERVPABLB-1P60509 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
ERVPABLB-1P60509 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
ERVPABLB-1P60509 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
ERVPABLB-1P60509 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
ERVPABLB-1P60509 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
ERVPABLB-1P60509 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
ERVPABLB-1P60509 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
ERVPABLB-1P60509 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ERVPABLB-1P60509 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
ERVPABLB-1P60509 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ERVPABLB-1P60509 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
ERVPABLB-1P60509 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
ERVPABLB-1P60509 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
ERVPABLB-1P60509 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
ERVPABLB-1P60509 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
ERVPABLB-1P60509 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
ERVPABLB-1P60509 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
ERVPABLB-1P60509 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
ERVPABLB-1P60509 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
ERVPABLB-1P60509 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
ERVPABLB-1P60509 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
ERVPABLB-1P60509 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
ERVPABLB-1P60509 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
ERVPABLB-1P60509 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
ERVPABLB-1P60509 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
ERVPABLB-1P60509 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
ERVPABLB-1P60509 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
ERVPABLB-1P60509 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
ERVPABLB-1P60509 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
ERVPABLB-1P60509 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
ERVPABLB-1P60509 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
ERVPABLB-1P60509 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
ERVPABLB-1P60509 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
ERVPABLB-1P60509 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
ERVPABLB-1P60509 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
ERVPABLB-1P60509 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
ERVPABLB-1P60509 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC20.97■□□□□ 0.95
ERVPABLB-1P60509 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
ERVPABLB-1P60509 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
ERVPABLB-1P60509 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
ERVPABLB-1P60509 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC20.97■□□□□ 0.95
ERVPABLB-1P60509 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
ERVPABLB-1P60509 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms