Protein–RNA interactions for Protein: P59894

DCDC1, Doublecortin domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 354 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCDC1P59894 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
DCDC1P59894 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
DCDC1P59894 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
DCDC1P59894 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
DCDC1P59894 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
DCDC1P59894 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
DCDC1P59894 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
DCDC1P59894 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
DCDC1P59894 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
DCDC1P59894 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
DCDC1P59894 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
DCDC1P59894 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
DCDC1P59894 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
DCDC1P59894 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
DCDC1P59894 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
DCDC1P59894 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
DCDC1P59894 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
DCDC1P59894 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
DCDC1P59894 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
DCDC1P59894 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
DCDC1P59894 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
DCDC1P59894 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
DCDC1P59894 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
DCDC1P59894 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
DCDC1P59894 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
DCDC1P59894 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
DCDC1P59894 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
DCDC1P59894 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
DCDC1P59894 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
DCDC1P59894 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
DCDC1P59894 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
DCDC1P59894 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
DCDC1P59894 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
DCDC1P59894 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
DCDC1P59894 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
DCDC1P59894 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
DCDC1P59894 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
DCDC1P59894 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
DCDC1P59894 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
DCDC1P59894 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
DCDC1P59894 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
DCDC1P59894 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
DCDC1P59894 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
DCDC1P59894 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
DCDC1P59894 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
DCDC1P59894 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
DCDC1P59894 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
DCDC1P59894 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
DCDC1P59894 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
DCDC1P59894 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
DCDC1P59894 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
DCDC1P59894 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
DCDC1P59894 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
DCDC1P59894 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
DCDC1P59894 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
DCDC1P59894 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
DCDC1P59894 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
DCDC1P59894 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
DCDC1P59894 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
DCDC1P59894 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
DCDC1P59894 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
DCDC1P59894 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
DCDC1P59894 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
DCDC1P59894 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
DCDC1P59894 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
DCDC1P59894 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
DCDC1P59894 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
DCDC1P59894 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
DCDC1P59894 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC21.01■□□□□ 0.95
DCDC1P59894 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
DCDC1P59894 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
DCDC1P59894 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
DCDC1P59894 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
DCDC1P59894 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
DCDC1P59894 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
DCDC1P59894 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
DCDC1P59894 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
DCDC1P59894 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
DCDC1P59894 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
DCDC1P59894 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
DCDC1P59894 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
DCDC1P59894 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
DCDC1P59894 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
DCDC1P59894 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
DCDC1P59894 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
DCDC1P59894 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
DCDC1P59894 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
DCDC1P59894 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
DCDC1P59894 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
DCDC1P59894 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
DCDC1P59894 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
DCDC1P59894 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
DCDC1P59894 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
DCDC1P59894 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
DCDC1P59894 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
DCDC1P59894 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
DCDC1P59894 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
DCDC1P59894 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
DCDC1P59894 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
DCDC1P59894 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms