Protein–RNA interactions for Protein: P58872

RHBDL3, Rhomboid-related protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHBDL3P58872 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
RHBDL3P58872 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
RHBDL3P58872 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
RHBDL3P58872 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
RHBDL3P58872 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
RHBDL3P58872 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
RHBDL3P58872 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
RHBDL3P58872 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
RHBDL3P58872 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
RHBDL3P58872 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
RHBDL3P58872 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
RHBDL3P58872 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
RHBDL3P58872 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
RHBDL3P58872 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
RHBDL3P58872 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
RHBDL3P58872 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
RHBDL3P58872 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
RHBDL3P58872 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
RHBDL3P58872 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
RHBDL3P58872 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
RHBDL3P58872 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
RHBDL3P58872 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
RHBDL3P58872 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
RHBDL3P58872 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
RHBDL3P58872 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
RHBDL3P58872 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
RHBDL3P58872 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
RHBDL3P58872 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
RHBDL3P58872 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
RHBDL3P58872 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
RHBDL3P58872 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
RHBDL3P58872 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
RHBDL3P58872 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
RHBDL3P58872 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
RHBDL3P58872 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
RHBDL3P58872 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
RHBDL3P58872 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
RHBDL3P58872 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
RHBDL3P58872 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
RHBDL3P58872 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
RHBDL3P58872 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC25.25■■□□□ 1.63
RHBDL3P58872 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
RHBDL3P58872 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
RHBDL3P58872 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
RHBDL3P58872 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
RHBDL3P58872 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
RHBDL3P58872 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
RHBDL3P58872 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
RHBDL3P58872 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
RHBDL3P58872 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
RHBDL3P58872 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
RHBDL3P58872 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
RHBDL3P58872 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
RHBDL3P58872 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
RHBDL3P58872 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
RHBDL3P58872 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
RHBDL3P58872 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
RHBDL3P58872 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
RHBDL3P58872 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
RHBDL3P58872 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
RHBDL3P58872 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
RHBDL3P58872 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
RHBDL3P58872 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
RHBDL3P58872 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
RHBDL3P58872 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
RHBDL3P58872 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
RHBDL3P58872 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
RHBDL3P58872 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
RHBDL3P58872 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
RHBDL3P58872 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
RHBDL3P58872 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
RHBDL3P58872 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
RHBDL3P58872 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
RHBDL3P58872 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
RHBDL3P58872 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
RHBDL3P58872 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
RHBDL3P58872 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
RHBDL3P58872 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
RHBDL3P58872 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
RHBDL3P58872 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
RHBDL3P58872 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
RHBDL3P58872 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
RHBDL3P58872 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
RHBDL3P58872 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
RHBDL3P58872 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
RHBDL3P58872 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
RHBDL3P58872 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
RHBDL3P58872 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC25.22■■□□□ 1.63
RHBDL3P58872 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
RHBDL3P58872 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
RHBDL3P58872 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
RHBDL3P58872 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
RHBDL3P58872 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
RHBDL3P58872 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
RHBDL3P58872 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
RHBDL3P58872 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
RHBDL3P58872 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
RHBDL3P58872 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
RHBDL3P58872 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
RHBDL3P58872 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.7 ms