Protein–RNA interactions for Protein: P57773

GJA9, Gap junction alpha-9 protein, humanhuman

Predictions only

Length 515 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJA9P57773 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
GJA9P57773 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
GJA9P57773 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
GJA9P57773 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
GJA9P57773 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
GJA9P57773 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
GJA9P57773 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
GJA9P57773 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
GJA9P57773 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
GJA9P57773 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
GJA9P57773 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
GJA9P57773 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
GJA9P57773 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
GJA9P57773 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
GJA9P57773 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
GJA9P57773 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
GJA9P57773 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
GJA9P57773 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.39
GJA9P57773 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
GJA9P57773 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
GJA9P57773 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
GJA9P57773 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
GJA9P57773 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
GJA9P57773 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
GJA9P57773 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
GJA9P57773 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
GJA9P57773 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
GJA9P57773 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
GJA9P57773 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
GJA9P57773 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
GJA9P57773 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
GJA9P57773 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
GJA9P57773 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
GJA9P57773 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC23.69■■□□□ 1.38
GJA9P57773 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
GJA9P57773 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
GJA9P57773 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
GJA9P57773 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
GJA9P57773 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
GJA9P57773 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
GJA9P57773 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
GJA9P57773 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
GJA9P57773 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
GJA9P57773 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC23.69■■□□□ 1.38
GJA9P57773 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
GJA9P57773 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
GJA9P57773 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
GJA9P57773 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
GJA9P57773 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
GJA9P57773 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
GJA9P57773 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
GJA9P57773 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
GJA9P57773 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
GJA9P57773 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
GJA9P57773 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
GJA9P57773 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
GJA9P57773 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
GJA9P57773 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
GJA9P57773 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
GJA9P57773 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
GJA9P57773 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
GJA9P57773 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
GJA9P57773 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
GJA9P57773 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
GJA9P57773 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
GJA9P57773 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
GJA9P57773 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
GJA9P57773 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
GJA9P57773 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
GJA9P57773 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
GJA9P57773 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
GJA9P57773 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
GJA9P57773 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
GJA9P57773 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
GJA9P57773 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
GJA9P57773 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
GJA9P57773 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
GJA9P57773 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
GJA9P57773 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
GJA9P57773 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
GJA9P57773 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
GJA9P57773 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
GJA9P57773 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
GJA9P57773 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
GJA9P57773 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
GJA9P57773 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
GJA9P57773 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
GJA9P57773 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
GJA9P57773 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
GJA9P57773 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
GJA9P57773 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
GJA9P57773 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
GJA9P57773 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
GJA9P57773 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
GJA9P57773 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
GJA9P57773 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
GJA9P57773 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
GJA9P57773 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
GJA9P57773 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
GJA9P57773 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.7 ms