Protein–RNA interactions for Protein: P57768

SNX16, Sorting nexin-16, humanhuman

Predictions only

Length 344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX16P57768 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SNX16P57768 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SNX16P57768 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SNX16P57768 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SNX16P57768 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SNX16P57768 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SNX16P57768 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SNX16P57768 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SNX16P57768 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SNX16P57768 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SNX16P57768 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SNX16P57768 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SNX16P57768 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SNX16P57768 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SNX16P57768 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SNX16P57768 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
SNX16P57768 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SNX16P57768 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SNX16P57768 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SNX16P57768 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SNX16P57768 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SNX16P57768 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SNX16P57768 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SNX16P57768 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SNX16P57768 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SNX16P57768 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SNX16P57768 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SNX16P57768 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SNX16P57768 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SNX16P57768 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SNX16P57768 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SNX16P57768 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SNX16P57768 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SNX16P57768 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SNX16P57768 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SNX16P57768 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SNX16P57768 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SNX16P57768 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SNX16P57768 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SNX16P57768 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SNX16P57768 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SNX16P57768 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SNX16P57768 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SNX16P57768 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SNX16P57768 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SNX16P57768 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SNX16P57768 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SNX16P57768 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SNX16P57768 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SNX16P57768 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SNX16P57768 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SNX16P57768 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SNX16P57768 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SNX16P57768 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SNX16P57768 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SNX16P57768 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SNX16P57768 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SNX16P57768 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SNX16P57768 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SNX16P57768 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SNX16P57768 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SNX16P57768 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SNX16P57768 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SNX16P57768 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SNX16P57768 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SNX16P57768 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SNX16P57768 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SNX16P57768 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SNX16P57768 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SNX16P57768 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SNX16P57768 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SNX16P57768 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SNX16P57768 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SNX16P57768 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SNX16P57768 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SNX16P57768 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SNX16P57768 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SNX16P57768 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SNX16P57768 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SNX16P57768 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SNX16P57768 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SNX16P57768 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SNX16P57768 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SNX16P57768 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SNX16P57768 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SNX16P57768 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
SNX16P57768 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.16
SNX16P57768 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SNX16P57768 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SNX16P57768 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SNX16P57768 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SNX16P57768 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SNX16P57768 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SNX16P57768 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SNX16P57768 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SNX16P57768 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SNX16P57768 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SNX16P57768 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SNX16P57768 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
SNX16P57768 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms