Protein–RNA interactions for Protein: P56817

BACE1, Beta-secretase 1, humanhuman

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BACE1P56817 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
BACE1P56817 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
BACE1P56817 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
BACE1P56817 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
BACE1P56817 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
BACE1P56817 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
BACE1P56817 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
BACE1P56817 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
BACE1P56817 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
BACE1P56817 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
BACE1P56817 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
BACE1P56817 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
BACE1P56817 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
BACE1P56817 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
BACE1P56817 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
BACE1P56817 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
BACE1P56817 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
BACE1P56817 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
BACE1P56817 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
BACE1P56817 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
BACE1P56817 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
BACE1P56817 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
BACE1P56817 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
BACE1P56817 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
BACE1P56817 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
BACE1P56817 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
BACE1P56817 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
BACE1P56817 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
BACE1P56817 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
BACE1P56817 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
BACE1P56817 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
BACE1P56817 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
BACE1P56817 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
BACE1P56817 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
BACE1P56817 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
BACE1P56817 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
BACE1P56817 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
BACE1P56817 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
BACE1P56817 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
BACE1P56817 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
BACE1P56817 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
BACE1P56817 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
BACE1P56817 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
BACE1P56817 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
BACE1P56817 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
BACE1P56817 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
BACE1P56817 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
BACE1P56817 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
BACE1P56817 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
BACE1P56817 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
BACE1P56817 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
BACE1P56817 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
BACE1P56817 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
BACE1P56817 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
BACE1P56817 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
BACE1P56817 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
BACE1P56817 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
BACE1P56817 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
BACE1P56817 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
BACE1P56817 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
BACE1P56817 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
BACE1P56817 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
BACE1P56817 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
BACE1P56817 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
BACE1P56817 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
BACE1P56817 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
BACE1P56817 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
BACE1P56817 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
BACE1P56817 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC24.6■■□□□ 1.53
BACE1P56817 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
BACE1P56817 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
BACE1P56817 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
BACE1P56817 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
BACE1P56817 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
BACE1P56817 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
BACE1P56817 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
BACE1P56817 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
BACE1P56817 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
BACE1P56817 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC24.59■■□□□ 1.53
BACE1P56817 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
BACE1P56817 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
BACE1P56817 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
BACE1P56817 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
BACE1P56817 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
BACE1P56817 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
BACE1P56817 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
BACE1P56817 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
BACE1P56817 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
BACE1P56817 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
BACE1P56817 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
BACE1P56817 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
BACE1P56817 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
BACE1P56817 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
BACE1P56817 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
BACE1P56817 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
BACE1P56817 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
BACE1P56817 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
BACE1P56817 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
BACE1P56817 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
BACE1P56817 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.6 ms