Protein–RNA interactions for Protein: P56159

GFRA1, GDNF family receptor alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GFRA1P56159 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
GFRA1P56159 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
GFRA1P56159 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
GFRA1P56159 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
GFRA1P56159 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
GFRA1P56159 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
GFRA1P56159 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
GFRA1P56159 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
GFRA1P56159 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
GFRA1P56159 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
GFRA1P56159 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
GFRA1P56159 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
GFRA1P56159 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
GFRA1P56159 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC19.07■□□□□ 0.64
GFRA1P56159 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
GFRA1P56159 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
GFRA1P56159 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
GFRA1P56159 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
GFRA1P56159 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
GFRA1P56159 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
GFRA1P56159 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
GFRA1P56159 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
GFRA1P56159 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
GFRA1P56159 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
GFRA1P56159 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
GFRA1P56159 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
GFRA1P56159 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
GFRA1P56159 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
GFRA1P56159 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
GFRA1P56159 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
GFRA1P56159 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
GFRA1P56159 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
GFRA1P56159 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
GFRA1P56159 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
GFRA1P56159 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
GFRA1P56159 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
GFRA1P56159 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
GFRA1P56159 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
GFRA1P56159 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
GFRA1P56159 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
GFRA1P56159 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
GFRA1P56159 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
GFRA1P56159 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
GFRA1P56159 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
GFRA1P56159 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
GFRA1P56159 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
GFRA1P56159 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
GFRA1P56159 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
GFRA1P56159 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
GFRA1P56159 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
GFRA1P56159 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
GFRA1P56159 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
GFRA1P56159 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
GFRA1P56159 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
GFRA1P56159 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
GFRA1P56159 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
GFRA1P56159 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
GFRA1P56159 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
GFRA1P56159 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
GFRA1P56159 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
GFRA1P56159 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
GFRA1P56159 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
GFRA1P56159 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
GFRA1P56159 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
GFRA1P56159 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
GFRA1P56159 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
GFRA1P56159 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
GFRA1P56159 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
GFRA1P56159 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC19.04■□□□□ 0.64
GFRA1P56159 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
GFRA1P56159 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
GFRA1P56159 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
GFRA1P56159 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
GFRA1P56159 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
GFRA1P56159 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
GFRA1P56159 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
GFRA1P56159 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
GFRA1P56159 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
GFRA1P56159 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
GFRA1P56159 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
GFRA1P56159 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
GFRA1P56159 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
GFRA1P56159 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC19.03■□□□□ 0.64
GFRA1P56159 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
GFRA1P56159 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
GFRA1P56159 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
GFRA1P56159 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
GFRA1P56159 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
GFRA1P56159 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
GFRA1P56159 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
GFRA1P56159 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
GFRA1P56159 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
GFRA1P56159 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
GFRA1P56159 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
GFRA1P56159 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
GFRA1P56159 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
GFRA1P56159 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
GFRA1P56159 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
GFRA1P56159 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
GFRA1P56159 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.1 ms