Protein–RNA interactions for Protein: P55199

ELL, RNA polymerase II elongation factor ELL, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ELLP55199 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
ELLP55199 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ELLP55199 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ELLP55199 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ELLP55199 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ELLP55199 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ELLP55199 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ELLP55199 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ELLP55199 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ELLP55199 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ELLP55199 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
ELLP55199 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ELLP55199 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ELLP55199 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ELLP55199 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ELLP55199 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ELLP55199 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ELLP55199 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ELLP55199 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ELLP55199 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ELLP55199 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ELLP55199 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ELLP55199 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ELLP55199 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ELLP55199 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ELLP55199 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ELLP55199 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ELLP55199 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ELLP55199 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ELLP55199 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ELLP55199 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ELLP55199 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ELLP55199 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ELLP55199 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ELLP55199 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ELLP55199 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ELLP55199 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ELLP55199 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ELLP55199 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ELLP55199 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ELLP55199 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ELLP55199 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ELLP55199 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ELLP55199 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ELLP55199 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ELLP55199 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ELLP55199 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ELLP55199 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ELLP55199 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ELLP55199 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ELLP55199 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ELLP55199 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ELLP55199 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ELLP55199 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ELLP55199 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ELLP55199 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ELLP55199 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ELLP55199 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ELLP55199 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ELLP55199 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ELLP55199 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ELLP55199 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ELLP55199 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ELLP55199 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ELLP55199 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ELLP55199 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ELLP55199 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ELLP55199 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ELLP55199 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ELLP55199 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ELLP55199 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ELLP55199 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ELLP55199 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ELLP55199 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ELLP55199 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ELLP55199 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ELLP55199 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
ELLP55199 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ELLP55199 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ELLP55199 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ELLP55199 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ELLP55199 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ELLP55199 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ELLP55199 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ELLP55199 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ELLP55199 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ELLP55199 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ELLP55199 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ELLP55199 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ELLP55199 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ELLP55199 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ELLP55199 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ELLP55199 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ELLP55199 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ELLP55199 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ELLP55199 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ELLP55199 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ELLP55199 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ELLP55199 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ELLP55199 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.2 ms