Protein–RNA interactions for Protein: P53794

SLC5A3, Sodium/myo-inositol cotransporter, humanhuman

Predictions only

Length 718 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC5A3P53794 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC5A3P53794 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC5A3P53794 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC5A3P53794 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLC5A3P53794 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLC5A3P53794 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLC5A3P53794 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLC5A3P53794 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLC5A3P53794 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLC5A3P53794 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLC5A3P53794 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLC5A3P53794 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
SLC5A3P53794 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLC5A3P53794 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLC5A3P53794 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLC5A3P53794 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLC5A3P53794 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
SLC5A3P53794 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SLC5A3P53794 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SLC5A3P53794 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SLC5A3P53794 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SLC5A3P53794 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SLC5A3P53794 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SLC5A3P53794 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SLC5A3P53794 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SLC5A3P53794 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SLC5A3P53794 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SLC5A3P53794 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SLC5A3P53794 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SLC5A3P53794 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SLC5A3P53794 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SLC5A3P53794 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SLC5A3P53794 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SLC5A3P53794 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SLC5A3P53794 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
SLC5A3P53794 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SLC5A3P53794 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SLC5A3P53794 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SLC5A3P53794 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SLC5A3P53794 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SLC5A3P53794 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SLC5A3P53794 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SLC5A3P53794 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SLC5A3P53794 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SLC5A3P53794 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SLC5A3P53794 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SLC5A3P53794 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SLC5A3P53794 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SLC5A3P53794 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SLC5A3P53794 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SLC5A3P53794 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SLC5A3P53794 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SLC5A3P53794 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SLC5A3P53794 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SLC5A3P53794 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
SLC5A3P53794 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
SLC5A3P53794 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SLC5A3P53794 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SLC5A3P53794 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SLC5A3P53794 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
SLC5A3P53794 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLC5A3P53794 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLC5A3P53794 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLC5A3P53794 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLC5A3P53794 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLC5A3P53794 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLC5A3P53794 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLC5A3P53794 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLC5A3P53794 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
SLC5A3P53794 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
SLC5A3P53794 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLC5A3P53794 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLC5A3P53794 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLC5A3P53794 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLC5A3P53794 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLC5A3P53794 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLC5A3P53794 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLC5A3P53794 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLC5A3P53794 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLC5A3P53794 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLC5A3P53794 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLC5A3P53794 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
SLC5A3P53794 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLC5A3P53794 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLC5A3P53794 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
SLC5A3P53794 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLC5A3P53794 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLC5A3P53794 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLC5A3P53794 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLC5A3P53794 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLC5A3P53794 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLC5A3P53794 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLC5A3P53794 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLC5A3P53794 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLC5A3P53794 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SLC5A3P53794 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SLC5A3P53794 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SLC5A3P53794 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SLC5A3P53794 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
SLC5A3P53794 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms