Protein–RNA interactions for Protein: P51965

UBE2E1, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 E1, humanhuman

Predictions only

Length 193 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2E1P51965 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC17.21■□□□□ 0.35
UBE2E1P51965 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC17.21■□□□□ 0.35
UBE2E1P51965 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
UBE2E1P51965 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
UBE2E1P51965 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
UBE2E1P51965 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
UBE2E1P51965 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
UBE2E1P51965 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
UBE2E1P51965 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
UBE2E1P51965 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
UBE2E1P51965 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
UBE2E1P51965 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
UBE2E1P51965 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
UBE2E1P51965 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
UBE2E1P51965 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
UBE2E1P51965 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
UBE2E1P51965 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
UBE2E1P51965 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
UBE2E1P51965 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
UBE2E1P51965 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
UBE2E1P51965 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
UBE2E1P51965 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
UBE2E1P51965 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
UBE2E1P51965 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
UBE2E1P51965 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
UBE2E1P51965 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
UBE2E1P51965 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
UBE2E1P51965 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
UBE2E1P51965 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
UBE2E1P51965 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
UBE2E1P51965 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
UBE2E1P51965 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
UBE2E1P51965 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
UBE2E1P51965 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
UBE2E1P51965 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
UBE2E1P51965 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
UBE2E1P51965 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
UBE2E1P51965 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
UBE2E1P51965 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
UBE2E1P51965 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
UBE2E1P51965 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
UBE2E1P51965 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
UBE2E1P51965 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
UBE2E1P51965 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
UBE2E1P51965 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
UBE2E1P51965 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
UBE2E1P51965 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
UBE2E1P51965 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
UBE2E1P51965 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
UBE2E1P51965 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
UBE2E1P51965 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
UBE2E1P51965 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
UBE2E1P51965 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
UBE2E1P51965 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
UBE2E1P51965 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
UBE2E1P51965 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
UBE2E1P51965 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
UBE2E1P51965 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
UBE2E1P51965 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
UBE2E1P51965 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
UBE2E1P51965 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
UBE2E1P51965 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
UBE2E1P51965 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
UBE2E1P51965 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
UBE2E1P51965 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
UBE2E1P51965 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
UBE2E1P51965 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
UBE2E1P51965 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
UBE2E1P51965 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
UBE2E1P51965 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
UBE2E1P51965 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
UBE2E1P51965 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
UBE2E1P51965 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
UBE2E1P51965 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
UBE2E1P51965 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
UBE2E1P51965 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
UBE2E1P51965 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
UBE2E1P51965 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
UBE2E1P51965 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
UBE2E1P51965 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
UBE2E1P51965 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
UBE2E1P51965 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
UBE2E1P51965 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
UBE2E1P51965 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
UBE2E1P51965 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
UBE2E1P51965 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
UBE2E1P51965 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
UBE2E1P51965 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
UBE2E1P51965 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
UBE2E1P51965 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
UBE2E1P51965 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
UBE2E1P51965 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
UBE2E1P51965 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
UBE2E1P51965 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
UBE2E1P51965 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
UBE2E1P51965 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
UBE2E1P51965 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
UBE2E1P51965 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
UBE2E1P51965 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
UBE2E1P51965 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.2 ms