Protein–RNA interactions for Protein: P51957

NEK4, Serine/threonine-protein kinase Nek4, humanhuman

Predictions only

Length 841 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEK4P51957 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
NEK4P51957 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
NEK4P51957 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
NEK4P51957 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
NEK4P51957 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
NEK4P51957 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
NEK4P51957 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
NEK4P51957 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
NEK4P51957 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
NEK4P51957 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
NEK4P51957 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
NEK4P51957 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
NEK4P51957 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
NEK4P51957 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
NEK4P51957 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
NEK4P51957 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC25.23■■□□□ 1.63
NEK4P51957 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
NEK4P51957 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
NEK4P51957 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
NEK4P51957 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
NEK4P51957 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
NEK4P51957 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
NEK4P51957 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
NEK4P51957 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
NEK4P51957 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
NEK4P51957 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
NEK4P51957 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
NEK4P51957 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
NEK4P51957 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
NEK4P51957 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
NEK4P51957 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
NEK4P51957 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
NEK4P51957 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
NEK4P51957 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
NEK4P51957 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
NEK4P51957 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
NEK4P51957 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
NEK4P51957 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
NEK4P51957 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
NEK4P51957 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
NEK4P51957 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
NEK4P51957 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
NEK4P51957 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
NEK4P51957 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
NEK4P51957 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
NEK4P51957 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
NEK4P51957 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
NEK4P51957 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
NEK4P51957 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
NEK4P51957 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
NEK4P51957 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
NEK4P51957 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
NEK4P51957 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
NEK4P51957 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
NEK4P51957 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
NEK4P51957 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
NEK4P51957 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
NEK4P51957 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
NEK4P51957 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
NEK4P51957 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
NEK4P51957 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
NEK4P51957 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
NEK4P51957 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
NEK4P51957 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
NEK4P51957 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
NEK4P51957 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
NEK4P51957 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
NEK4P51957 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
NEK4P51957 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
NEK4P51957 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
NEK4P51957 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
NEK4P51957 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
NEK4P51957 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
NEK4P51957 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
NEK4P51957 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
NEK4P51957 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
NEK4P51957 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
NEK4P51957 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
NEK4P51957 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
NEK4P51957 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
NEK4P51957 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
NEK4P51957 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
NEK4P51957 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
NEK4P51957 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
NEK4P51957 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.18■■□□□ 1.62
NEK4P51957 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
NEK4P51957 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
NEK4P51957 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
NEK4P51957 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
NEK4P51957 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
NEK4P51957 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
NEK4P51957 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
NEK4P51957 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
NEK4P51957 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
NEK4P51957 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
NEK4P51957 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
NEK4P51957 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
NEK4P51957 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
NEK4P51957 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
NEK4P51957 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.1 ms