Protein–RNA interactions for Protein: P50990

CCT8, T-complex protein 1 subunit theta, humanhuman

Predictions only

Length 548 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCT8P50990 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CCT8P50990 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CCT8P50990 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CCT8P50990 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
CCT8P50990 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC21.3■■□□□ 1
CCT8P50990 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC21.3■■□□□ 1
CCT8P50990 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CCT8P50990 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
CCT8P50990 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
CCT8P50990 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CCT8P50990 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
CCT8P50990 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CCT8P50990 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CCT8P50990 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CCT8P50990 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC21.29■■□□□ 1
CCT8P50990 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CCT8P50990 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CCT8P50990 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CCT8P50990 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CCT8P50990 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CCT8P50990 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CCT8P50990 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CCT8P50990 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC21.29■■□□□ 1
CCT8P50990 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CCT8P50990 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CCT8P50990 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CCT8P50990 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CCT8P50990 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CCT8P50990 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CCT8P50990 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CCT8P50990 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC21.28■■□□□ 1
CCT8P50990 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC21.28■■□□□ 1
CCT8P50990 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CCT8P50990 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CCT8P50990 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CCT8P50990 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CCT8P50990 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
CCT8P50990 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CCT8P50990 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
CCT8P50990 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
CCT8P50990 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC21.27■■□□□ 1
CCT8P50990 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
CCT8P50990 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC21.27■■□□□ 1
CCT8P50990 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CCT8P50990 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
CCT8P50990 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
CCT8P50990 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
CCT8P50990 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
CCT8P50990 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCT8P50990 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCT8P50990 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCT8P50990 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
CCT8P50990 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCT8P50990 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCT8P50990 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCT8P50990 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCT8P50990 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCT8P50990 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCT8P50990 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCT8P50990 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCT8P50990 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCT8P50990 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCT8P50990 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCT8P50990 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCT8P50990 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCT8P50990 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCT8P50990 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
CCT8P50990 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCT8P50990 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCT8P50990 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCT8P50990 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCT8P50990 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCT8P50990 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCT8P50990 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCT8P50990 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCT8P50990 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCT8P50990 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCT8P50990 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCT8P50990 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCT8P50990 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCT8P50990 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCT8P50990 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCT8P50990 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCT8P50990 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCT8P50990 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCT8P50990 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCT8P50990 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCT8P50990 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCT8P50990 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCT8P50990 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCT8P50990 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCT8P50990 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCT8P50990 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCT8P50990 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCT8P50990 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCT8P50990 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCT8P50990 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCT8P50990 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCT8P50990 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCT8P50990 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36 ms