Protein–RNA interactions for Protein: P50895

BCAM, Basal cell adhesion molecule, humanhuman

Predictions only

Length 628 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BCAMP50895 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
BCAMP50895 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
BCAMP50895 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
BCAMP50895 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
BCAMP50895 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
BCAMP50895 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
BCAMP50895 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
BCAMP50895 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
BCAMP50895 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
BCAMP50895 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
BCAMP50895 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
BCAMP50895 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
BCAMP50895 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
BCAMP50895 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
BCAMP50895 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
BCAMP50895 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
BCAMP50895 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
BCAMP50895 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
BCAMP50895 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
BCAMP50895 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
BCAMP50895 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
BCAMP50895 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
BCAMP50895 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
BCAMP50895 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
BCAMP50895 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
BCAMP50895 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
BCAMP50895 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
BCAMP50895 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
BCAMP50895 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
BCAMP50895 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC25.84■■□□□ 1.73
BCAMP50895 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
BCAMP50895 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
BCAMP50895 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
BCAMP50895 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
BCAMP50895 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC25.84■■□□□ 1.73
BCAMP50895 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
BCAMP50895 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
BCAMP50895 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
BCAMP50895 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
BCAMP50895 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
BCAMP50895 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
BCAMP50895 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
BCAMP50895 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
BCAMP50895 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
BCAMP50895 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
BCAMP50895 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
BCAMP50895 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
BCAMP50895 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
BCAMP50895 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
BCAMP50895 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
BCAMP50895 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
BCAMP50895 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
BCAMP50895 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
BCAMP50895 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
BCAMP50895 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
BCAMP50895 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
BCAMP50895 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
BCAMP50895 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
BCAMP50895 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
BCAMP50895 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
BCAMP50895 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
BCAMP50895 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
BCAMP50895 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
BCAMP50895 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
BCAMP50895 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
BCAMP50895 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
BCAMP50895 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
BCAMP50895 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
BCAMP50895 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
BCAMP50895 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
BCAMP50895 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
BCAMP50895 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
BCAMP50895 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
BCAMP50895 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
BCAMP50895 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
BCAMP50895 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
BCAMP50895 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
BCAMP50895 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
BCAMP50895 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
BCAMP50895 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
BCAMP50895 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
BCAMP50895 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
BCAMP50895 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
BCAMP50895 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
BCAMP50895 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
BCAMP50895 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
BCAMP50895 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
BCAMP50895 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
BCAMP50895 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
BCAMP50895 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
BCAMP50895 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
BCAMP50895 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
BCAMP50895 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
BCAMP50895 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
BCAMP50895 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
BCAMP50895 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
BCAMP50895 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
BCAMP50895 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
BCAMP50895 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
BCAMP50895 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17 ms