Protein–RNA interactions for Protein: P49959

MRE11, Double-strand break repair protein MRE11, humanhuman

Predictions only

Length 708 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRE11P49959 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
MRE11P49959 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
MRE11P49959 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
MRE11P49959 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
MRE11P49959 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
MRE11P49959 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
MRE11P49959 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
MRE11P49959 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
MRE11P49959 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
MRE11P49959 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
MRE11P49959 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
MRE11P49959 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
MRE11P49959 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
MRE11P49959 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
MRE11P49959 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
MRE11P49959 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
MRE11P49959 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
MRE11P49959 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
MRE11P49959 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
MRE11P49959 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
MRE11P49959 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
MRE11P49959 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
MRE11P49959 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
MRE11P49959 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
MRE11P49959 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
MRE11P49959 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
MRE11P49959 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
MRE11P49959 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
MRE11P49959 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
MRE11P49959 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
MRE11P49959 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
MRE11P49959 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
MRE11P49959 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
MRE11P49959 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
MRE11P49959 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
MRE11P49959 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
MRE11P49959 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
MRE11P49959 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
MRE11P49959 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
MRE11P49959 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
MRE11P49959 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
MRE11P49959 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
MRE11P49959 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
MRE11P49959 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
MRE11P49959 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
MRE11P49959 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
MRE11P49959 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
MRE11P49959 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
MRE11P49959 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
MRE11P49959 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
MRE11P49959 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
MRE11P49959 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
MRE11P49959 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
MRE11P49959 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
MRE11P49959 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
MRE11P49959 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.51■■□□□ 1.51
MRE11P49959 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
MRE11P49959 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
MRE11P49959 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
MRE11P49959 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
MRE11P49959 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
MRE11P49959 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
MRE11P49959 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
MRE11P49959 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
MRE11P49959 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
MRE11P49959 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
MRE11P49959 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
MRE11P49959 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
MRE11P49959 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
MRE11P49959 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
MRE11P49959 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
MRE11P49959 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
MRE11P49959 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
MRE11P49959 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
MRE11P49959 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
MRE11P49959 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
MRE11P49959 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
MRE11P49959 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
MRE11P49959 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
MRE11P49959 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
MRE11P49959 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
MRE11P49959 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
MRE11P49959 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
MRE11P49959 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
MRE11P49959 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
MRE11P49959 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
MRE11P49959 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
MRE11P49959 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
MRE11P49959 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
MRE11P49959 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
MRE11P49959 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
MRE11P49959 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
MRE11P49959 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
MRE11P49959 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
MRE11P49959 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
MRE11P49959 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
MRE11P49959 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
MRE11P49959 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
MRE11P49959 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
MRE11P49959 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.9 ms