Protein–RNA interactions for Protein: P49848

TAF6, Transcription initiation factor TFIID subunit 6, humanhuman

Predictions only

Length 677 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF6P49848 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TAF6P49848 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TAF6P49848 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TAF6P49848 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TAF6P49848 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TAF6P49848 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TAF6P49848 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TAF6P49848 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
TAF6P49848 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TAF6P49848 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
TAF6P49848 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TAF6P49848 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
TAF6P49848 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TAF6P49848 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TAF6P49848 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TAF6P49848 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TAF6P49848 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TAF6P49848 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TAF6P49848 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TAF6P49848 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TAF6P49848 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TAF6P49848 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TAF6P49848 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TAF6P49848 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
TAF6P49848 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TAF6P49848 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TAF6P49848 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TAF6P49848 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TAF6P49848 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TAF6P49848 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TAF6P49848 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TAF6P49848 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TAF6P49848 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TAF6P49848 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TAF6P49848 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TAF6P49848 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TAF6P49848 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TAF6P49848 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TAF6P49848 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
TAF6P49848 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TAF6P49848 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TAF6P49848 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TAF6P49848 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TAF6P49848 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TAF6P49848 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TAF6P49848 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TAF6P49848 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TAF6P49848 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TAF6P49848 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
TAF6P49848 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TAF6P49848 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TAF6P49848 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TAF6P49848 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TAF6P49848 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TAF6P49848 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TAF6P49848 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TAF6P49848 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TAF6P49848 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TAF6P49848 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TAF6P49848 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TAF6P49848 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TAF6P49848 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TAF6P49848 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TAF6P49848 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TAF6P49848 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TAF6P49848 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TAF6P49848 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TAF6P49848 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TAF6P49848 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TAF6P49848 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
TAF6P49848 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TAF6P49848 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TAF6P49848 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TAF6P49848 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TAF6P49848 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TAF6P49848 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
TAF6P49848 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
TAF6P49848 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
TAF6P49848 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TAF6P49848 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TAF6P49848 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TAF6P49848 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TAF6P49848 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TAF6P49848 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TAF6P49848 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TAF6P49848 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TAF6P49848 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TAF6P49848 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TAF6P49848 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TAF6P49848 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
TAF6P49848 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TAF6P49848 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TAF6P49848 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TAF6P49848 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TAF6P49848 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TAF6P49848 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
TAF6P49848 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
TAF6P49848 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TAF6P49848 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TAF6P49848 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms