Protein–RNA interactions for Protein: P49841

GSK3B, Glycogen synthase kinase-3 beta, humanhuman

Predictions only

Length 420 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GSK3BP49841 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
GSK3BP49841 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
GSK3BP49841 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
GSK3BP49841 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
GSK3BP49841 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
GSK3BP49841 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
GSK3BP49841 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
GSK3BP49841 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
GSK3BP49841 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
GSK3BP49841 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
GSK3BP49841 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
GSK3BP49841 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
GSK3BP49841 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
GSK3BP49841 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
GSK3BP49841 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
GSK3BP49841 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
GSK3BP49841 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
GSK3BP49841 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
GSK3BP49841 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
GSK3BP49841 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
GSK3BP49841 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
GSK3BP49841 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
GSK3BP49841 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
GSK3BP49841 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
GSK3BP49841 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
GSK3BP49841 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
GSK3BP49841 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
GSK3BP49841 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
GSK3BP49841 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
GSK3BP49841 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
GSK3BP49841 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
GSK3BP49841 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
GSK3BP49841 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
GSK3BP49841 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
GSK3BP49841 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
GSK3BP49841 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
GSK3BP49841 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
GSK3BP49841 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
GSK3BP49841 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
GSK3BP49841 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
GSK3BP49841 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
GSK3BP49841 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
GSK3BP49841 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
GSK3BP49841 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
GSK3BP49841 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
GSK3BP49841 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
GSK3BP49841 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
GSK3BP49841 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
GSK3BP49841 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
GSK3BP49841 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
GSK3BP49841 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
GSK3BP49841 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
GSK3BP49841 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
GSK3BP49841 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
GSK3BP49841 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
GSK3BP49841 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
GSK3BP49841 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
GSK3BP49841 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
GSK3BP49841 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
GSK3BP49841 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
GSK3BP49841 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
GSK3BP49841 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
GSK3BP49841 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
GSK3BP49841 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
GSK3BP49841 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
GSK3BP49841 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
GSK3BP49841 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
GSK3BP49841 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
GSK3BP49841 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
GSK3BP49841 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
GSK3BP49841 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
GSK3BP49841 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
GSK3BP49841 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
GSK3BP49841 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
GSK3BP49841 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
GSK3BP49841 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
GSK3BP49841 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
GSK3BP49841 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
GSK3BP49841 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
GSK3BP49841 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
GSK3BP49841 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
GSK3BP49841 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
GSK3BP49841 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
GSK3BP49841 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
GSK3BP49841 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
GSK3BP49841 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
GSK3BP49841 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
GSK3BP49841 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
GSK3BP49841 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
GSK3BP49841 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
GSK3BP49841 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
GSK3BP49841 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
GSK3BP49841 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
GSK3BP49841 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
GSK3BP49841 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
GSK3BP49841 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
GSK3BP49841 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
GSK3BP49841 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
GSK3BP49841 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
GSK3BP49841 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms