Protein–RNA interactions for Protein: P49638

TTPA, Alpha-tocopherol transfer protein, humanhuman

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Length 278 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTPAP49638 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TTPAP49638 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
TTPAP49638 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
TTPAP49638 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TTPAP49638 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TTPAP49638 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TTPAP49638 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
TTPAP49638 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
TTPAP49638 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TTPAP49638 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
TTPAP49638 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
TTPAP49638 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
TTPAP49638 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
TTPAP49638 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TTPAP49638 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
TTPAP49638 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TTPAP49638 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
TTPAP49638 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TTPAP49638 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
TTPAP49638 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TTPAP49638 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
TTPAP49638 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
TTPAP49638 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TTPAP49638 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
TTPAP49638 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TTPAP49638 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TTPAP49638 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TTPAP49638 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TTPAP49638 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TTPAP49638 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
TTPAP49638 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
TTPAP49638 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TTPAP49638 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TTPAP49638 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TTPAP49638 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
TTPAP49638 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
TTPAP49638 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
TTPAP49638 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TTPAP49638 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TTPAP49638 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
TTPAP49638 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TTPAP49638 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
TTPAP49638 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
TTPAP49638 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC21.04■□□□□ 0.96
TTPAP49638 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TTPAP49638 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TTPAP49638 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
TTPAP49638 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TTPAP49638 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TTPAP49638 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TTPAP49638 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
TTPAP49638 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
TTPAP49638 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
TTPAP49638 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
TTPAP49638 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
TTPAP49638 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
TTPAP49638 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
TTPAP49638 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
TTPAP49638 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
TTPAP49638 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
TTPAP49638 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
TTPAP49638 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
TTPAP49638 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
TTPAP49638 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
TTPAP49638 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
TTPAP49638 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
TTPAP49638 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
TTPAP49638 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
TTPAP49638 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
TTPAP49638 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
TTPAP49638 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
TTPAP49638 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
TTPAP49638 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
TTPAP49638 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
TTPAP49638 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
TTPAP49638 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
TTPAP49638 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.95
TTPAP49638 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.95
TTPAP49638 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC21.02■□□□□ 0.95
TTPAP49638 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.95
TTPAP49638 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
TTPAP49638 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
TTPAP49638 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
TTPAP49638 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
TTPAP49638 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
TTPAP49638 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
TTPAP49638 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
TTPAP49638 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
TTPAP49638 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
TTPAP49638 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
TTPAP49638 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
TTPAP49638 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
TTPAP49638 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
TTPAP49638 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
TTPAP49638 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
TTPAP49638 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
TTPAP49638 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
TTPAP49638 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
TTPAP49638 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
TTPAP49638 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
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