Protein–RNA interactions for Protein: P49590

HARS2, Probable histidine--tRNA ligase, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 506 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HARS2P49590 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
HARS2P49590 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
HARS2P49590 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
HARS2P49590 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
HARS2P49590 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
HARS2P49590 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
HARS2P49590 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
HARS2P49590 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
HARS2P49590 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
HARS2P49590 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
HARS2P49590 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
HARS2P49590 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
HARS2P49590 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
HARS2P49590 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
HARS2P49590 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
HARS2P49590 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
HARS2P49590 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
HARS2P49590 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
HARS2P49590 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
HARS2P49590 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
HARS2P49590 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
HARS2P49590 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
HARS2P49590 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
HARS2P49590 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
HARS2P49590 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
HARS2P49590 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
HARS2P49590 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
HARS2P49590 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
HARS2P49590 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
HARS2P49590 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
HARS2P49590 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
HARS2P49590 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
HARS2P49590 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
HARS2P49590 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
HARS2P49590 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
HARS2P49590 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
HARS2P49590 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
HARS2P49590 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
HARS2P49590 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
HARS2P49590 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
HARS2P49590 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
HARS2P49590 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
HARS2P49590 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
HARS2P49590 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
HARS2P49590 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
HARS2P49590 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
HARS2P49590 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
HARS2P49590 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
HARS2P49590 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
HARS2P49590 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
HARS2P49590 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
HARS2P49590 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
HARS2P49590 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
HARS2P49590 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
HARS2P49590 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HARS2P49590 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HARS2P49590 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
HARS2P49590 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HARS2P49590 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
HARS2P49590 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HARS2P49590 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HARS2P49590 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
HARS2P49590 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HARS2P49590 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HARS2P49590 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HARS2P49590 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HARS2P49590 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HARS2P49590 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
HARS2P49590 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
HARS2P49590 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
HARS2P49590 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
HARS2P49590 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
HARS2P49590 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
HARS2P49590 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HARS2P49590 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HARS2P49590 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
HARS2P49590 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
HARS2P49590 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HARS2P49590 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
HARS2P49590 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HARS2P49590 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HARS2P49590 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HARS2P49590 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HARS2P49590 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HARS2P49590 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HARS2P49590 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
HARS2P49590 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
HARS2P49590 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HARS2P49590 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HARS2P49590 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HARS2P49590 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
HARS2P49590 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HARS2P49590 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
HARS2P49590 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HARS2P49590 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HARS2P49590 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HARS2P49590 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HARS2P49590 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
HARS2P49590 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HARS2P49590 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.1 ms