Protein–RNA interactions for Protein: P49279

SLC11A1, Natural resistance-associated macrophage protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 550 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC11A1P49279 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC11A1P49279 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC11A1P49279 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC11A1P49279 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC11A1P49279 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC11A1P49279 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC11A1P49279 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC11A1P49279 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC11A1P49279 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC11A1P49279 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC11A1P49279 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC11A1P49279 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC11A1P49279 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC11A1P49279 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC11A1P49279 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC11A1P49279 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC11A1P49279 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC11A1P49279 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC11A1P49279 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC11A1P49279 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC11A1P49279 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC11A1P49279 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC11A1P49279 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC11A1P49279 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC11A1P49279 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC11A1P49279 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SLC11A1P49279 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
SLC11A1P49279 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SLC11A1P49279 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
SLC11A1P49279 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SLC11A1P49279 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SLC11A1P49279 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SLC11A1P49279 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SLC11A1P49279 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SLC11A1P49279 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SLC11A1P49279 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SLC11A1P49279 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SLC11A1P49279 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SLC11A1P49279 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SLC11A1P49279 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
SLC11A1P49279 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SLC11A1P49279 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SLC11A1P49279 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SLC11A1P49279 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SLC11A1P49279 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SLC11A1P49279 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SLC11A1P49279 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
SLC11A1P49279 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SLC11A1P49279 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLC11A1P49279 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLC11A1P49279 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLC11A1P49279 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLC11A1P49279 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLC11A1P49279 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLC11A1P49279 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
SLC11A1P49279 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLC11A1P49279 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLC11A1P49279 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLC11A1P49279 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLC11A1P49279 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLC11A1P49279 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLC11A1P49279 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLC11A1P49279 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLC11A1P49279 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLC11A1P49279 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.22
SLC11A1P49279 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.22
SLC11A1P49279 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
SLC11A1P49279 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
SLC11A1P49279 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
SLC11A1P49279 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SLC11A1P49279 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
SLC11A1P49279 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SLC11A1P49279 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SLC11A1P49279 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SLC11A1P49279 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SLC11A1P49279 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SLC11A1P49279 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SLC11A1P49279 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SLC11A1P49279 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SLC11A1P49279 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SLC11A1P49279 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SLC11A1P49279 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SLC11A1P49279 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SLC11A1P49279 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SLC11A1P49279 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SLC11A1P49279 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SLC11A1P49279 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SLC11A1P49279 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SLC11A1P49279 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SLC11A1P49279 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SLC11A1P49279 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SLC11A1P49279 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SLC11A1P49279 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SLC11A1P49279 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SLC11A1P49279 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SLC11A1P49279 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SLC11A1P49279 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SLC11A1P49279 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SLC11A1P49279 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SLC11A1P49279 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms