Protein–RNA interactions for Protein: P48507

GCLM, Glutamate--cysteine ligase regulatory subunit, humanhuman

Predictions only

Length 274 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCLMP48507 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
GCLMP48507 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
GCLMP48507 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
GCLMP48507 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
GCLMP48507 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
GCLMP48507 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
GCLMP48507 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
GCLMP48507 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
GCLMP48507 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
GCLMP48507 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
GCLMP48507 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
GCLMP48507 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
GCLMP48507 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
GCLMP48507 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
GCLMP48507 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
GCLMP48507 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
GCLMP48507 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
GCLMP48507 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
GCLMP48507 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
GCLMP48507 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
GCLMP48507 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
GCLMP48507 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
GCLMP48507 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
GCLMP48507 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
GCLMP48507 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
GCLMP48507 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
GCLMP48507 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
GCLMP48507 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC22.97■■□□□ 1.27
GCLMP48507 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
GCLMP48507 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
GCLMP48507 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
GCLMP48507 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
GCLMP48507 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
GCLMP48507 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
GCLMP48507 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
GCLMP48507 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
GCLMP48507 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
GCLMP48507 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
GCLMP48507 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
GCLMP48507 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
GCLMP48507 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
GCLMP48507 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
GCLMP48507 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
GCLMP48507 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
GCLMP48507 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
GCLMP48507 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
GCLMP48507 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
GCLMP48507 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
GCLMP48507 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
GCLMP48507 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
GCLMP48507 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
GCLMP48507 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
GCLMP48507 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
GCLMP48507 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
GCLMP48507 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
GCLMP48507 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
GCLMP48507 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
GCLMP48507 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
GCLMP48507 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
GCLMP48507 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
GCLMP48507 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
GCLMP48507 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
GCLMP48507 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
GCLMP48507 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
GCLMP48507 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
GCLMP48507 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
GCLMP48507 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
GCLMP48507 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
GCLMP48507 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
GCLMP48507 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
GCLMP48507 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
GCLMP48507 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
GCLMP48507 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
GCLMP48507 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
GCLMP48507 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
GCLMP48507 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
GCLMP48507 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
GCLMP48507 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
GCLMP48507 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
GCLMP48507 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
GCLMP48507 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
GCLMP48507 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
GCLMP48507 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
GCLMP48507 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
GCLMP48507 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
GCLMP48507 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
GCLMP48507 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
GCLMP48507 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
GCLMP48507 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
GCLMP48507 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
GCLMP48507 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
GCLMP48507 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC22.94■■□□□ 1.26
GCLMP48507 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
GCLMP48507 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
GCLMP48507 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
GCLMP48507 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
GCLMP48507 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
GCLMP48507 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
GCLMP48507 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
GCLMP48507 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.7 ms