Protein–RNA interactions for Protein: P48169

GABRA4, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 554 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRA4P48169 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
GABRA4P48169 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
GABRA4P48169 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
GABRA4P48169 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
GABRA4P48169 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
GABRA4P48169 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
GABRA4P48169 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
GABRA4P48169 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
GABRA4P48169 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
GABRA4P48169 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
GABRA4P48169 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
GABRA4P48169 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
GABRA4P48169 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
GABRA4P48169 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
GABRA4P48169 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
GABRA4P48169 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
GABRA4P48169 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
GABRA4P48169 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
GABRA4P48169 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
GABRA4P48169 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
GABRA4P48169 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
GABRA4P48169 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
GABRA4P48169 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
GABRA4P48169 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
GABRA4P48169 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
GABRA4P48169 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
GABRA4P48169 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
GABRA4P48169 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
GABRA4P48169 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
GABRA4P48169 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
GABRA4P48169 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
GABRA4P48169 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
GABRA4P48169 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
GABRA4P48169 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
GABRA4P48169 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
GABRA4P48169 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
GABRA4P48169 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
GABRA4P48169 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
GABRA4P48169 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
GABRA4P48169 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
GABRA4P48169 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
GABRA4P48169 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
GABRA4P48169 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
GABRA4P48169 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC20.17■□□□□ 0.82
GABRA4P48169 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
GABRA4P48169 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
GABRA4P48169 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
GABRA4P48169 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
GABRA4P48169 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
GABRA4P48169 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
GABRA4P48169 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
GABRA4P48169 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
GABRA4P48169 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
GABRA4P48169 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
GABRA4P48169 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
GABRA4P48169 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
GABRA4P48169 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
GABRA4P48169 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
GABRA4P48169 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
GABRA4P48169 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
GABRA4P48169 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
GABRA4P48169 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
GABRA4P48169 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
GABRA4P48169 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
GABRA4P48169 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
GABRA4P48169 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
GABRA4P48169 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
GABRA4P48169 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
GABRA4P48169 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
GABRA4P48169 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
GABRA4P48169 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
GABRA4P48169 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
GABRA4P48169 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
GABRA4P48169 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
GABRA4P48169 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
GABRA4P48169 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
GABRA4P48169 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
GABRA4P48169 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
GABRA4P48169 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
GABRA4P48169 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
GABRA4P48169 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
GABRA4P48169 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
GABRA4P48169 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
GABRA4P48169 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
GABRA4P48169 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
GABRA4P48169 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
GABRA4P48169 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
GABRA4P48169 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
GABRA4P48169 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
GABRA4P48169 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
GABRA4P48169 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
GABRA4P48169 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.14■□□□□ 0.81
GABRA4P48169 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
GABRA4P48169 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC20.14■□□□□ 0.81
GABRA4P48169 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
GABRA4P48169 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
GABRA4P48169 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
GABRA4P48169 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
GABRA4P48169 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
GABRA4P48169 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.4 ms