Protein–RNA interactions for Protein: P46939

UTRN, Utrophin, humanhuman

Predictions only

Length 3,433 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UTRNP46939 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
UTRNP46939 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
UTRNP46939 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
UTRNP46939 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
UTRNP46939 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
UTRNP46939 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
UTRNP46939 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
UTRNP46939 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
UTRNP46939 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
UTRNP46939 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
UTRNP46939 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
UTRNP46939 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
UTRNP46939 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
UTRNP46939 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
UTRNP46939 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
UTRNP46939 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
UTRNP46939 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
UTRNP46939 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
UTRNP46939 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
UTRNP46939 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
UTRNP46939 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
UTRNP46939 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
UTRNP46939 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
UTRNP46939 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
UTRNP46939 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
UTRNP46939 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
UTRNP46939 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
UTRNP46939 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
UTRNP46939 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
UTRNP46939 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
UTRNP46939 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
UTRNP46939 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC26.39■■□□□ 1.81
UTRNP46939 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
UTRNP46939 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
UTRNP46939 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
UTRNP46939 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
UTRNP46939 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
UTRNP46939 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
UTRNP46939 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
UTRNP46939 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
UTRNP46939 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
UTRNP46939 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
UTRNP46939 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
UTRNP46939 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
UTRNP46939 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
UTRNP46939 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC26.37■■□□□ 1.81
UTRNP46939 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
UTRNP46939 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
UTRNP46939 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
UTRNP46939 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC26.37■■□□□ 1.81
UTRNP46939 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
UTRNP46939 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
UTRNP46939 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
UTRNP46939 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
UTRNP46939 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
UTRNP46939 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
UTRNP46939 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
UTRNP46939 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
UTRNP46939 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC26.36■■□□□ 1.81
UTRNP46939 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
UTRNP46939 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
UTRNP46939 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
UTRNP46939 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
UTRNP46939 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
UTRNP46939 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
UTRNP46939 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
UTRNP46939 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
UTRNP46939 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
UTRNP46939 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
UTRNP46939 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
UTRNP46939 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
UTRNP46939 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
UTRNP46939 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
UTRNP46939 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
UTRNP46939 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
UTRNP46939 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
UTRNP46939 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
UTRNP46939 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
UTRNP46939 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
UTRNP46939 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
UTRNP46939 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
UTRNP46939 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC26.35■■□□□ 1.81
UTRNP46939 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
UTRNP46939 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
UTRNP46939 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
UTRNP46939 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
UTRNP46939 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
UTRNP46939 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC26.34■■□□□ 1.81
UTRNP46939 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
UTRNP46939 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
UTRNP46939 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC26.34■■□□□ 1.81
UTRNP46939 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
UTRNP46939 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
UTRNP46939 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
UTRNP46939 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.33■■□□□ 1.81
UTRNP46939 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
UTRNP46939 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC26.33■■□□□ 1.81
UTRNP46939 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC26.33■■□□□ 1.81
UTRNP46939 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
UTRNP46939 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms