Protein–RNA interactions for Protein: P46926

GNPDA1, Glucosamine-6-phosphate isomerase 1, humanhuman

Predictions only

Length 289 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GNPDA1P46926 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
GNPDA1P46926 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
GNPDA1P46926 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
GNPDA1P46926 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
GNPDA1P46926 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
GNPDA1P46926 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
GNPDA1P46926 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
GNPDA1P46926 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
GNPDA1P46926 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
GNPDA1P46926 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
GNPDA1P46926 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
GNPDA1P46926 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
GNPDA1P46926 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
GNPDA1P46926 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
GNPDA1P46926 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
GNPDA1P46926 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
GNPDA1P46926 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
GNPDA1P46926 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
GNPDA1P46926 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
GNPDA1P46926 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
GNPDA1P46926 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
GNPDA1P46926 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
GNPDA1P46926 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
GNPDA1P46926 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
GNPDA1P46926 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
GNPDA1P46926 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
GNPDA1P46926 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
GNPDA1P46926 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
GNPDA1P46926 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
GNPDA1P46926 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
GNPDA1P46926 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
GNPDA1P46926 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
GNPDA1P46926 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
GNPDA1P46926 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
GNPDA1P46926 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
GNPDA1P46926 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
GNPDA1P46926 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
GNPDA1P46926 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
GNPDA1P46926 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
GNPDA1P46926 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
GNPDA1P46926 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
GNPDA1P46926 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
GNPDA1P46926 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
GNPDA1P46926 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
GNPDA1P46926 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
GNPDA1P46926 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
GNPDA1P46926 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
GNPDA1P46926 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
GNPDA1P46926 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
GNPDA1P46926 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
GNPDA1P46926 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
GNPDA1P46926 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC21.07■□□□□ 0.96
GNPDA1P46926 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
GNPDA1P46926 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
GNPDA1P46926 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
GNPDA1P46926 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
GNPDA1P46926 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
GNPDA1P46926 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
GNPDA1P46926 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
GNPDA1P46926 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC21.06■□□□□ 0.96
GNPDA1P46926 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
GNPDA1P46926 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
GNPDA1P46926 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
GNPDA1P46926 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
GNPDA1P46926 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
GNPDA1P46926 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
GNPDA1P46926 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
GNPDA1P46926 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
GNPDA1P46926 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
GNPDA1P46926 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
GNPDA1P46926 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
GNPDA1P46926 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC21.05■□□□□ 0.96
GNPDA1P46926 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
GNPDA1P46926 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
GNPDA1P46926 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
GNPDA1P46926 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
GNPDA1P46926 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
GNPDA1P46926 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
GNPDA1P46926 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
GNPDA1P46926 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
GNPDA1P46926 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
GNPDA1P46926 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
GNPDA1P46926 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
GNPDA1P46926 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
GNPDA1P46926 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
GNPDA1P46926 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
GNPDA1P46926 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
GNPDA1P46926 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
GNPDA1P46926 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
GNPDA1P46926 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
GNPDA1P46926 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
GNPDA1P46926 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
GNPDA1P46926 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
GNPDA1P46926 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
GNPDA1P46926 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC21.04■□□□□ 0.96
GNPDA1P46926 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
GNPDA1P46926 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
GNPDA1P46926 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
GNPDA1P46926 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
GNPDA1P46926 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.4 ms