Protein–RNA interactions for Protein: P43897

TSFM, Elongation factor Ts, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSFMP43897 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TSFMP43897 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TSFMP43897 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TSFMP43897 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TSFMP43897 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TSFMP43897 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TSFMP43897 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TSFMP43897 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TSFMP43897 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TSFMP43897 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TSFMP43897 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TSFMP43897 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TSFMP43897 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TSFMP43897 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TSFMP43897 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TSFMP43897 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TSFMP43897 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TSFMP43897 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TSFMP43897 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TSFMP43897 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TSFMP43897 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TSFMP43897 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TSFMP43897 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TSFMP43897 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TSFMP43897 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TSFMP43897 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TSFMP43897 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TSFMP43897 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TSFMP43897 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TSFMP43897 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TSFMP43897 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TSFMP43897 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TSFMP43897 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TSFMP43897 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TSFMP43897 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TSFMP43897 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TSFMP43897 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TSFMP43897 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TSFMP43897 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TSFMP43897 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TSFMP43897 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TSFMP43897 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TSFMP43897 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TSFMP43897 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TSFMP43897 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TSFMP43897 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TSFMP43897 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TSFMP43897 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TSFMP43897 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TSFMP43897 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TSFMP43897 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TSFMP43897 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TSFMP43897 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TSFMP43897 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TSFMP43897 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TSFMP43897 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TSFMP43897 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TSFMP43897 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TSFMP43897 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TSFMP43897 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TSFMP43897 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TSFMP43897 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TSFMP43897 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TSFMP43897 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TSFMP43897 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TSFMP43897 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TSFMP43897 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
TSFMP43897 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TSFMP43897 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TSFMP43897 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TSFMP43897 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TSFMP43897 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TSFMP43897 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TSFMP43897 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TSFMP43897 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TSFMP43897 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TSFMP43897 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TSFMP43897 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TSFMP43897 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
TSFMP43897 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TSFMP43897 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TSFMP43897 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TSFMP43897 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TSFMP43897 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TSFMP43897 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TSFMP43897 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TSFMP43897 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TSFMP43897 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TSFMP43897 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TSFMP43897 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TSFMP43897 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TSFMP43897 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TSFMP43897 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TSFMP43897 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TSFMP43897 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TSFMP43897 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TSFMP43897 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TSFMP43897 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TSFMP43897 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TSFMP43897 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.9 ms