Protein–RNA interactions for Protein: P43007

SLC1A4, Neutral amino acid transporter A, humanhuman

Predictions only

Length 532 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC1A4P43007 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
SLC1A4P43007 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SLC1A4P43007 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SLC1A4P43007 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SLC1A4P43007 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SLC1A4P43007 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SLC1A4P43007 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SLC1A4P43007 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SLC1A4P43007 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SLC1A4P43007 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SLC1A4P43007 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SLC1A4P43007 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SLC1A4P43007 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SLC1A4P43007 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SLC1A4P43007 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SLC1A4P43007 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SLC1A4P43007 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SLC1A4P43007 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SLC1A4P43007 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SLC1A4P43007 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SLC1A4P43007 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SLC1A4P43007 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SLC1A4P43007 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SLC1A4P43007 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SLC1A4P43007 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SLC1A4P43007 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SLC1A4P43007 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SLC1A4P43007 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SLC1A4P43007 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
SLC1A4P43007 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SLC1A4P43007 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SLC1A4P43007 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SLC1A4P43007 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SLC1A4P43007 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SLC1A4P43007 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SLC1A4P43007 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SLC1A4P43007 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SLC1A4P43007 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SLC1A4P43007 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SLC1A4P43007 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SLC1A4P43007 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SLC1A4P43007 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SLC1A4P43007 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SLC1A4P43007 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SLC1A4P43007 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
SLC1A4P43007 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SLC1A4P43007 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SLC1A4P43007 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SLC1A4P43007 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SLC1A4P43007 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SLC1A4P43007 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
SLC1A4P43007 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SLC1A4P43007 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SLC1A4P43007 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SLC1A4P43007 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SLC1A4P43007 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SLC1A4P43007 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SLC1A4P43007 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SLC1A4P43007 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SLC1A4P43007 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SLC1A4P43007 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SLC1A4P43007 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SLC1A4P43007 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SLC1A4P43007 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SLC1A4P43007 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
SLC1A4P43007 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SLC1A4P43007 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SLC1A4P43007 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SLC1A4P43007 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SLC1A4P43007 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
SLC1A4P43007 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SLC1A4P43007 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SLC1A4P43007 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
SLC1A4P43007 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SLC1A4P43007 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
SLC1A4P43007 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SLC1A4P43007 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SLC1A4P43007 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
SLC1A4P43007 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
SLC1A4P43007 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
SLC1A4P43007 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
SLC1A4P43007 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
SLC1A4P43007 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC24.64■■□□□ 1.53
SLC1A4P43007 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
SLC1A4P43007 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
SLC1A4P43007 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
SLC1A4P43007 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
SLC1A4P43007 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
SLC1A4P43007 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
SLC1A4P43007 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SLC1A4P43007 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SLC1A4P43007 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SLC1A4P43007 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SLC1A4P43007 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SLC1A4P43007 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SLC1A4P43007 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SLC1A4P43007 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SLC1A4P43007 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SLC1A4P43007 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
SLC1A4P43007 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.6 ms