Protein–RNA interactions for Protein: P43004

SLC1A2, Excitatory amino acid transporter 2, humanhuman

Predictions only

Length 574 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC1A2P43004 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SLC1A2P43004 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SLC1A2P43004 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SLC1A2P43004 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
SLC1A2P43004 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
SLC1A2P43004 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
SLC1A2P43004 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
SLC1A2P43004 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
SLC1A2P43004 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SLC1A2P43004 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SLC1A2P43004 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SLC1A2P43004 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SLC1A2P43004 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SLC1A2P43004 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SLC1A2P43004 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SLC1A2P43004 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SLC1A2P43004 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
SLC1A2P43004 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SLC1A2P43004 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SLC1A2P43004 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SLC1A2P43004 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SLC1A2P43004 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SLC1A2P43004 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SLC1A2P43004 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SLC1A2P43004 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SLC1A2P43004 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SLC1A2P43004 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SLC1A2P43004 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SLC1A2P43004 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SLC1A2P43004 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SLC1A2P43004 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SLC1A2P43004 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SLC1A2P43004 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SLC1A2P43004 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SLC1A2P43004 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SLC1A2P43004 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SLC1A2P43004 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SLC1A2P43004 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SLC1A2P43004 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SLC1A2P43004 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SLC1A2P43004 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SLC1A2P43004 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SLC1A2P43004 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SLC1A2P43004 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
SLC1A2P43004 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SLC1A2P43004 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SLC1A2P43004 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SLC1A2P43004 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SLC1A2P43004 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SLC1A2P43004 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SLC1A2P43004 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SLC1A2P43004 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
SLC1A2P43004 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SLC1A2P43004 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SLC1A2P43004 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SLC1A2P43004 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SLC1A2P43004 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SLC1A2P43004 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SLC1A2P43004 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SLC1A2P43004 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
SLC1A2P43004 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SLC1A2P43004 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SLC1A2P43004 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SLC1A2P43004 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SLC1A2P43004 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SLC1A2P43004 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
SLC1A2P43004 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SLC1A2P43004 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SLC1A2P43004 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SLC1A2P43004 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SLC1A2P43004 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SLC1A2P43004 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SLC1A2P43004 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SLC1A2P43004 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SLC1A2P43004 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SLC1A2P43004 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SLC1A2P43004 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SLC1A2P43004 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SLC1A2P43004 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SLC1A2P43004 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SLC1A2P43004 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SLC1A2P43004 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SLC1A2P43004 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SLC1A2P43004 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SLC1A2P43004 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
SLC1A2P43004 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SLC1A2P43004 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SLC1A2P43004 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SLC1A2P43004 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SLC1A2P43004 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SLC1A2P43004 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SLC1A2P43004 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SLC1A2P43004 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SLC1A2P43004 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
SLC1A2P43004 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SLC1A2P43004 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SLC1A2P43004 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SLC1A2P43004 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SLC1A2P43004 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SLC1A2P43004 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms