Protein–RNA interactions for Protein: P42898

MTHFR, Methylenetetrahydrofolate reductase, humanhuman

Predictions only

Length 656 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTHFRP42898 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
MTHFRP42898 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
MTHFRP42898 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
MTHFRP42898 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
MTHFRP42898 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
MTHFRP42898 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
MTHFRP42898 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
MTHFRP42898 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
MTHFRP42898 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
MTHFRP42898 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
MTHFRP42898 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
MTHFRP42898 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
MTHFRP42898 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
MTHFRP42898 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
MTHFRP42898 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
MTHFRP42898 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
MTHFRP42898 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
MTHFRP42898 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
MTHFRP42898 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
MTHFRP42898 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
MTHFRP42898 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.24■■□□□ 1.15
MTHFRP42898 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
MTHFRP42898 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
MTHFRP42898 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
MTHFRP42898 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
MTHFRP42898 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
MTHFRP42898 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
MTHFRP42898 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
MTHFRP42898 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
MTHFRP42898 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
MTHFRP42898 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
MTHFRP42898 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
MTHFRP42898 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
MTHFRP42898 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
MTHFRP42898 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
MTHFRP42898 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
MTHFRP42898 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC22.23■■□□□ 1.15
MTHFRP42898 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
MTHFRP42898 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
MTHFRP42898 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
MTHFRP42898 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
MTHFRP42898 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
MTHFRP42898 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
MTHFRP42898 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
MTHFRP42898 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
MTHFRP42898 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
MTHFRP42898 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
MTHFRP42898 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
MTHFRP42898 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
MTHFRP42898 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
MTHFRP42898 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
MTHFRP42898 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
MTHFRP42898 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
MTHFRP42898 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
MTHFRP42898 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
MTHFRP42898 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
MTHFRP42898 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
MTHFRP42898 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
MTHFRP42898 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
MTHFRP42898 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
MTHFRP42898 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
MTHFRP42898 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
MTHFRP42898 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
MTHFRP42898 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
MTHFRP42898 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
MTHFRP42898 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
MTHFRP42898 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
MTHFRP42898 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MTHFRP42898 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MTHFRP42898 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
MTHFRP42898 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
MTHFRP42898 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MTHFRP42898 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MTHFRP42898 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
MTHFRP42898 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
MTHFRP42898 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MTHFRP42898 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
MTHFRP42898 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MTHFRP42898 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MTHFRP42898 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MTHFRP42898 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MTHFRP42898 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MTHFRP42898 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MTHFRP42898 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
MTHFRP42898 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
MTHFRP42898 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
MTHFRP42898 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
MTHFRP42898 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
MTHFRP42898 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
MTHFRP42898 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
MTHFRP42898 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
MTHFRP42898 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC22.2■■□□□ 1.14
MTHFRP42898 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
MTHFRP42898 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
MTHFRP42898 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
MTHFRP42898 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
MTHFRP42898 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
MTHFRP42898 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
MTHFRP42898 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
MTHFRP42898 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.9 ms