Protein–RNA interactions for Protein: P42338

PIK3CB, Phosphatidylinositol 4,5-bisphosphate 3-kinase catalytic subunit beta isoform, humanhuman

Predictions only

Length 1,070 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIK3CBP42338 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PIK3CBP42338 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PIK3CBP42338 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PIK3CBP42338 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PIK3CBP42338 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PIK3CBP42338 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PIK3CBP42338 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PIK3CBP42338 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PIK3CBP42338 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PIK3CBP42338 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
PIK3CBP42338 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PIK3CBP42338 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PIK3CBP42338 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PIK3CBP42338 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PIK3CBP42338 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PIK3CBP42338 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PIK3CBP42338 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PIK3CBP42338 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PIK3CBP42338 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PIK3CBP42338 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PIK3CBP42338 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
PIK3CBP42338 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PIK3CBP42338 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PIK3CBP42338 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PIK3CBP42338 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PIK3CBP42338 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PIK3CBP42338 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PIK3CBP42338 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PIK3CBP42338 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
PIK3CBP42338 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PIK3CBP42338 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
PIK3CBP42338 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PIK3CBP42338 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PIK3CBP42338 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PIK3CBP42338 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PIK3CBP42338 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PIK3CBP42338 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PIK3CBP42338 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PIK3CBP42338 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PIK3CBP42338 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PIK3CBP42338 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PIK3CBP42338 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PIK3CBP42338 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PIK3CBP42338 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PIK3CBP42338 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
PIK3CBP42338 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
PIK3CBP42338 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
PIK3CBP42338 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
PIK3CBP42338 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC20.33■□□□□ 0.85
PIK3CBP42338 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
PIK3CBP42338 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
PIK3CBP42338 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
PIK3CBP42338 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
PIK3CBP42338 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
PIK3CBP42338 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.84
PIK3CBP42338 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.84
PIK3CBP42338 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
PIK3CBP42338 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PIK3CBP42338 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PIK3CBP42338 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PIK3CBP42338 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PIK3CBP42338 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PIK3CBP42338 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PIK3CBP42338 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PIK3CBP42338 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PIK3CBP42338 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PIK3CBP42338 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PIK3CBP42338 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PIK3CBP42338 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PIK3CBP42338 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PIK3CBP42338 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PIK3CBP42338 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PIK3CBP42338 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PIK3CBP42338 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PIK3CBP42338 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PIK3CBP42338 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PIK3CBP42338 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PIK3CBP42338 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PIK3CBP42338 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PIK3CBP42338 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PIK3CBP42338 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PIK3CBP42338 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PIK3CBP42338 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PIK3CBP42338 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
PIK3CBP42338 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PIK3CBP42338 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PIK3CBP42338 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PIK3CBP42338 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PIK3CBP42338 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PIK3CBP42338 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PIK3CBP42338 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PIK3CBP42338 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PIK3CBP42338 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PIK3CBP42338 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PIK3CBP42338 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PIK3CBP42338 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PIK3CBP42338 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PIK3CBP42338 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PIK3CBP42338 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PIK3CBP42338 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms