Protein–RNA interactions for Protein: P40692

MLH1, DNA mismatch repair protein Mlh1, humanhuman

Predictions only

Length 756 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MLH1P40692 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
MLH1P40692 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
MLH1P40692 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
MLH1P40692 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
MLH1P40692 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
MLH1P40692 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
MLH1P40692 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
MLH1P40692 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
MLH1P40692 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
MLH1P40692 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
MLH1P40692 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
MLH1P40692 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
MLH1P40692 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
MLH1P40692 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
MLH1P40692 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
MLH1P40692 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
MLH1P40692 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
MLH1P40692 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
MLH1P40692 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
MLH1P40692 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
MLH1P40692 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
MLH1P40692 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
MLH1P40692 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
MLH1P40692 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
MLH1P40692 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
MLH1P40692 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
MLH1P40692 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
MLH1P40692 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
MLH1P40692 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
MLH1P40692 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
MLH1P40692 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
MLH1P40692 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
MLH1P40692 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
MLH1P40692 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
MLH1P40692 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
MLH1P40692 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
MLH1P40692 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
MLH1P40692 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
MLH1P40692 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
MLH1P40692 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
MLH1P40692 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
MLH1P40692 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
MLH1P40692 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
MLH1P40692 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
MLH1P40692 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
MLH1P40692 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
MLH1P40692 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
MLH1P40692 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
MLH1P40692 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
MLH1P40692 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
MLH1P40692 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
MLH1P40692 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
MLH1P40692 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
MLH1P40692 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
MLH1P40692 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
MLH1P40692 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
MLH1P40692 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
MLH1P40692 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
MLH1P40692 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
MLH1P40692 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
MLH1P40692 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
MLH1P40692 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
MLH1P40692 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
MLH1P40692 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
MLH1P40692 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
MLH1P40692 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
MLH1P40692 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
MLH1P40692 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
MLH1P40692 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
MLH1P40692 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
MLH1P40692 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
MLH1P40692 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
MLH1P40692 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
MLH1P40692 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
MLH1P40692 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC22.92■■□□□ 1.26
MLH1P40692 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
MLH1P40692 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
MLH1P40692 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
MLH1P40692 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
MLH1P40692 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC22.92■■□□□ 1.26
MLH1P40692 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
MLH1P40692 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
MLH1P40692 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
MLH1P40692 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
MLH1P40692 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
MLH1P40692 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
MLH1P40692 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
MLH1P40692 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC22.91■■□□□ 1.26
MLH1P40692 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
MLH1P40692 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
MLH1P40692 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
MLH1P40692 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
MLH1P40692 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
MLH1P40692 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
MLH1P40692 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
MLH1P40692 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
MLH1P40692 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
MLH1P40692 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
MLH1P40692 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
MLH1P40692 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.6 ms