Protein–RNA interactions for Protein: P40087

DDI1, DNA damage-inducible protein 1, yeastyeast

Predictions only

Length 428 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
DDI1P40087 YHR214C-DYHR214C-D 294 nt2.81□□□□□ -1.96
DDI1P40087 YIL024CYIL024C 570 nt2.81□□□□□ -1.96
DDI1P40087 EBP2YKL172W 1284 nt2.81□□□□□ -1.96
DDI1P40087 YAR069CYAR069C 294 nt2.81□□□□□ -1.96
DDI1P40087 RDN58-1RDN58-1 158 nt2.81□□□□□ -1.96
DDI1P40087 RDN58-2RDN58-2 158 nt2.81□□□□□ -1.96
DDI1P40087 PKP2YGL059W 1476 nt2.81□□□□□ -1.96
DDI1P40087 NOP4YPL043W 2058 nt2.81□□□□□ -1.96
DDI1P40087 SPP382YLR424W 2127 nt2.81□□□□□ -1.96
DDI1P40087 NMD2YHR077C 3270 nt2.8□□□□□ -1.96
DDI1P40087 ERG11YHR007C 1593 nt2.8□□□□□ -1.96
DDI1P40087 KIN3YAR018C 1308 nt2.8□□□□□ -1.96
DDI1P40087 HTA1YDR225W 399 nt2.8□□□□□ -1.96
DDI1P40087 MRM2YGL136C 963 nt2.8□□□□□ -1.96
DDI1P40087 YGL258W-AYGL258W-A 234 nt2.8□□□□□ -1.96
DDI1P40087 YGR039WYGR039W 312 nt2.8□□□□□ -1.96
DDI1P40087 YKL156C-AYKL156C-A 117 nt2.8□□□□□ -1.96
DDI1P40087 YKR011CYKR011C 1062 nt2.8□□□□□ -1.96
DDI1P40087 MTD1YKR080W 963 nt2.8□□□□□ -1.96
DDI1P40087 YBL028CYBL028C 321 nt2.8□□□□□ -1.96
DDI1P40087 YNL184CYNL184C 327 nt2.8□□□□□ -1.96
DDI1P40087 RUF5-1RUF5-1 710 nt2.8□□□□□ -1.96
DDI1P40087 RUF5-2RUF5-2 710 nt2.8□□□□□ -1.96
DDI1P40087 SAP1YER047C 2694 nt2.8□□□□□ -1.96
DDI1P40087 AKR1YDR264C 2295 nt2.8□□□□□ -1.96
DDI1P40087 YNR063WYNR063W 1824 nt2.79□□□□□ -1.96
DDI1P40087 RSN1YMR266W 2862 nt2.79□□□□□ -1.96
DDI1P40087 MOT1YPL082C 5604 nt2.79□□□□□ -1.96
DDI1P40087 VIP1YLR410W 3441 nt2.79□□□□□ -1.96
DDI1P40087 UBP8YMR223W 1416 nt2.79□□□□□ -1.96
DDI1P40087 VMA8YEL051W 771 nt2.79□□□□□ -1.96
DDI1P40087 YGR114CYGR114C 390 nt2.79□□□□□ -1.96
DDI1P40087 YJR128WYJR128W 360 nt2.79□□□□□ -1.96
DDI1P40087 CSM3YMR048W 954 nt2.79□□□□□ -1.96
DDI1P40087 YNR062CYNR062C 984 nt2.79□□□□□ -1.96
DDI1P40087 YNR068CYNR068C 819 nt2.79□□□□□ -1.96
DDI1P40087 PFY1YOR122C 381 nt2.79□□□□□ -1.96
DDI1P40087 SRB8YCR081W 4284 nt2.79□□□□□ -1.96
DDI1P40087 ARF1YDL192W 546 nt2.78□□□□□ -1.96
DDI1P40087 CDC26YFR036W 375 nt2.78□□□□□ -1.96
DDI1P40087 YHL005CYHL005C 393 nt2.78□□□□□ -1.96
DDI1P40087 SWD2YKL018W 990 nt2.78□□□□□ -1.96
DDI1P40087 YOR062CYOR062C 807 nt2.78□□□□□ -1.96
DDI1P40087 NTO1YPR031W 2247 nt2.78□□□□□ -1.96
DDI1P40087 DUN1YDL101C 1542 nt2.78□□□□□ -1.97
DDI1P40087 CEP3YMR168C 1827 nt2.77□□□□□ -1.97
DDI1P40087 RAD55YDR076W 1221 nt2.77□□□□□ -1.97
DDI1P40087 MTM1YGR257C 1101 nt2.77□□□□□ -1.97
DDI1P40087 PAU13YHL046C 363 nt2.77□□□□□ -1.97
DDI1P40087 RPL27AYHR010W 411 nt2.77□□□□□ -1.97
DDI1P40087 GTT1YIR038C 705 nt2.77□□□□□ -1.97
DDI1P40087 YLL037WYLL037W 381 nt2.77□□□□□ -1.97
DDI1P40087 YMR178WYMR178W 825 nt2.77□□□□□ -1.97
DDI1P40087 ERG2YMR202W 669 nt2.77□□□□□ -1.97
DDI1P40087 RUF20RUF20 443 nt2.77□□□□□ -1.97
DDI1P40087 EAF7YNL136W 1278 nt2.77□□□□□ -1.97
DDI1P40087 YOR114WYOR114W 885 nt2.77□□□□□ -1.97
DDI1P40087 PPT2YPL148C 522 nt2.77□□□□□ -1.97
DDI1P40087 YBR116CYBR116C 528 nt2.77□□□□□ -1.97
DDI1P40087 VPS3YDR495C 3036 nt2.77□□□□□ -1.97
DDI1P40087 MET5YJR137C 4329 nt2.77□□□□□ -1.97
DDI1P40087 CDC20YGL116W 1833 nt2.77□□□□□ -1.97
DDI1P40087 SPH1YLR313C 1593 nt2.76□□□□□ -1.97
DDI1P40087 JSN1YJR091C 3276 nt2.76□□□□□ -1.97
DDI1P40087 RIM1YCR028C-A 408 nt2.76□□□□□ -1.97
DDI1P40087 BMH2YDR099W 822 nt2.76□□□□□ -1.97
DDI1P40087 YEL075CYEL075C 369 nt2.76□□□□□ -1.97
DDI1P40087 ENV10YLR065C 546 nt2.76□□□□□ -1.97
DDI1P40087 IMP4YNL075W 873 nt2.76□□□□□ -1.97
DDI1P40087 YPR203WYPR203W 309 nt2.76□□□□□ -1.97
DDI1P40087 LDH1YBR204C 1128 nt2.76□□□□□ -1.97
DDI1P40087 VAS1YGR094W 3315 nt2.76□□□□□ -1.97
DDI1P40087 MRS2YOR334W 1413 nt2.76□□□□□ -1.97
DDI1P40087 PFF1YBR074W 2931 nt2.75□□□□□ -1.97
DDI1P40087 HFD1YMR110C 1599 nt2.75□□□□□ -1.97
DDI1P40087 YDL050CYDL050C 372 nt2.75□□□□□ -1.97
DDI1P40087 YDR090CYDR090C 933 nt2.75□□□□□ -1.97
DDI1P40087 PAU10YDR542W 363 nt2.75□□□□□ -1.97
DDI1P40087 PAU11YGL261C 363 nt2.75□□□□□ -1.97
DDI1P40087 RPS25AYGR027C 327 nt2.75□□□□□ -1.97
DDI1P40087 FIP1YJR093C 984 nt2.75□□□□□ -1.97
DDI1P40087 YLR297WYLR297W 390 nt2.75□□□□□ -1.97
DDI1P40087 PAU4YLR461W 363 nt2.75□□□□□ -1.97
DDI1P40087 RPS10BYMR230W 318 nt2.75□□□□□ -1.97
DDI1P40087 YNL109WYNL109W 546 nt2.75□□□□□ -1.97
DDI1P40087 AAR2YBL074C 1068 nt2.75□□□□□ -1.97
DDI1P40087 SYC1YOR179C 567 nt2.75□□□□□ -1.97
DDI1P40087 ATG5YPL149W 885 nt2.75□□□□□ -1.97
DDI1P40087 SPP381YBR152W 876 nt2.75□□□□□ -1.97
DDI1P40087 YOR296WYOR296W 3870 nt2.75□□□□□ -1.97
DDI1P40087 DUF1YOL087C 3351 nt2.75□□□□□ -1.97
DDI1P40087 ARI1YGL157W 1044 nt2.74□□□□□ -1.97
DDI1P40087 EFG1YGR271C-A 702 nt2.74□□□□□ -1.97
DDI1P40087 SIC1YLR079W 855 nt2.74□□□□□ -1.97
DDI1P40087 POP8YBL018C 402 nt2.74□□□□□ -1.97
DDI1P40087 RPL6AYML073C 531 nt2.74□□□□□ -1.97
DDI1P40087 YOL019W-AYOL019W-A 153 nt2.74□□□□□ -1.97
DDI1P40087 MCA1YOR197W 1299 nt2.74□□□□□ -1.97
DDI1P40087 CYR1YJL005W 6081 nt2.74□□□□□ -1.97
DDI1P40087 ECM29YHL030W 5607 nt2.74□□□□□ -1.97
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 25 ms