Protein–RNA interactions for Protein: P36383

GJC1, Gap junction gamma-1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 396 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJC1P36383 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
GJC1P36383 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GJC1P36383 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GJC1P36383 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GJC1P36383 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GJC1P36383 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GJC1P36383 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GJC1P36383 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GJC1P36383 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GJC1P36383 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GJC1P36383 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GJC1P36383 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GJC1P36383 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GJC1P36383 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
GJC1P36383 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GJC1P36383 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GJC1P36383 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
GJC1P36383 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
GJC1P36383 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GJC1P36383 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GJC1P36383 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GJC1P36383 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GJC1P36383 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GJC1P36383 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GJC1P36383 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GJC1P36383 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GJC1P36383 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
GJC1P36383 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GJC1P36383 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
GJC1P36383 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
GJC1P36383 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GJC1P36383 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GJC1P36383 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GJC1P36383 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
GJC1P36383 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GJC1P36383 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
GJC1P36383 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GJC1P36383 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GJC1P36383 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
GJC1P36383 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
GJC1P36383 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GJC1P36383 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GJC1P36383 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GJC1P36383 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
GJC1P36383 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
GJC1P36383 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
GJC1P36383 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GJC1P36383 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
GJC1P36383 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC22.29■■□□□ 1.16
GJC1P36383 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GJC1P36383 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GJC1P36383 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GJC1P36383 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC22.29■■□□□ 1.16
GJC1P36383 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GJC1P36383 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
GJC1P36383 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GJC1P36383 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GJC1P36383 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GJC1P36383 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GJC1P36383 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
GJC1P36383 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GJC1P36383 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
GJC1P36383 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GJC1P36383 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
GJC1P36383 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC22.28■■□□□ 1.16
GJC1P36383 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
GJC1P36383 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GJC1P36383 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GJC1P36383 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GJC1P36383 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
GJC1P36383 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
GJC1P36383 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
GJC1P36383 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
GJC1P36383 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
GJC1P36383 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GJC1P36383 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GJC1P36383 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GJC1P36383 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GJC1P36383 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GJC1P36383 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GJC1P36383 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GJC1P36383 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GJC1P36383 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GJC1P36383 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GJC1P36383 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GJC1P36383 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GJC1P36383 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
GJC1P36383 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
GJC1P36383 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
GJC1P36383 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
GJC1P36383 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
GJC1P36383 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
GJC1P36383 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GJC1P36383 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GJC1P36383 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
GJC1P36383 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GJC1P36383 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
GJC1P36383 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
GJC1P36383 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GJC1P36383 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.6 ms