Protein–RNA interactions for Protein: P35638

DDIT3, DNA damage-inducible transcript 3 protein, humanhuman

Predictions only

Length 169 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDIT3P35638 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
DDIT3P35638 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
DDIT3P35638 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
DDIT3P35638 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
DDIT3P35638 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
DDIT3P35638 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
DDIT3P35638 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
DDIT3P35638 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
DDIT3P35638 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
DDIT3P35638 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
DDIT3P35638 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
DDIT3P35638 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
DDIT3P35638 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
DDIT3P35638 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
DDIT3P35638 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
DDIT3P35638 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
DDIT3P35638 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
DDIT3P35638 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
DDIT3P35638 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
DDIT3P35638 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
DDIT3P35638 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
DDIT3P35638 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
DDIT3P35638 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
DDIT3P35638 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
DDIT3P35638 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
DDIT3P35638 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC24.95■■□□□ 1.58
DDIT3P35638 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
DDIT3P35638 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
DDIT3P35638 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
DDIT3P35638 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
DDIT3P35638 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
DDIT3P35638 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
DDIT3P35638 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
DDIT3P35638 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
DDIT3P35638 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
DDIT3P35638 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
DDIT3P35638 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
DDIT3P35638 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
DDIT3P35638 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
DDIT3P35638 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
DDIT3P35638 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
DDIT3P35638 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
DDIT3P35638 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
DDIT3P35638 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
DDIT3P35638 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
DDIT3P35638 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
DDIT3P35638 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
DDIT3P35638 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
DDIT3P35638 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
DDIT3P35638 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
DDIT3P35638 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
DDIT3P35638 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
DDIT3P35638 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
DDIT3P35638 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC24.92■■□□□ 1.58
DDIT3P35638 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
DDIT3P35638 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
DDIT3P35638 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
DDIT3P35638 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
DDIT3P35638 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
DDIT3P35638 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
DDIT3P35638 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
DDIT3P35638 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
DDIT3P35638 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
DDIT3P35638 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
DDIT3P35638 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
DDIT3P35638 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
DDIT3P35638 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
DDIT3P35638 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
DDIT3P35638 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
DDIT3P35638 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
DDIT3P35638 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
DDIT3P35638 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
DDIT3P35638 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
DDIT3P35638 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
DDIT3P35638 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
DDIT3P35638 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
DDIT3P35638 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
DDIT3P35638 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
DDIT3P35638 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
DDIT3P35638 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
DDIT3P35638 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
DDIT3P35638 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
DDIT3P35638 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
DDIT3P35638 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
DDIT3P35638 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
DDIT3P35638 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
DDIT3P35638 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
DDIT3P35638 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
DDIT3P35638 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
DDIT3P35638 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
DDIT3P35638 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
DDIT3P35638 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
DDIT3P35638 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
DDIT3P35638 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
DDIT3P35638 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
DDIT3P35638 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
DDIT3P35638 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
DDIT3P35638 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
DDIT3P35638 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
DDIT3P35638 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms