Protein–RNA interactions for Protein: P35453

HOXD13, Homeobox protein Hox-D13, humanhuman

Predictions only

Length 343 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD13P35453 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
HOXD13P35453 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
HOXD13P35453 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
HOXD13P35453 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
HOXD13P35453 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
HOXD13P35453 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
HOXD13P35453 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
HOXD13P35453 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
HOXD13P35453 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
HOXD13P35453 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
HOXD13P35453 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
HOXD13P35453 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
HOXD13P35453 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
HOXD13P35453 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
HOXD13P35453 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
HOXD13P35453 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
HOXD13P35453 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
HOXD13P35453 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
HOXD13P35453 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
HOXD13P35453 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
HOXD13P35453 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
HOXD13P35453 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
HOXD13P35453 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
HOXD13P35453 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
HOXD13P35453 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
HOXD13P35453 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
HOXD13P35453 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
HOXD13P35453 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
HOXD13P35453 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
HOXD13P35453 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
HOXD13P35453 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
HOXD13P35453 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC23.27■■□□□ 1.32
HOXD13P35453 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
HOXD13P35453 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
HOXD13P35453 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
HOXD13P35453 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
HOXD13P35453 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
HOXD13P35453 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
HOXD13P35453 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
HOXD13P35453 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
HOXD13P35453 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
HOXD13P35453 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
HOXD13P35453 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
HOXD13P35453 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
HOXD13P35453 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
HOXD13P35453 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
HOXD13P35453 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
HOXD13P35453 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
HOXD13P35453 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
HOXD13P35453 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
HOXD13P35453 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
HOXD13P35453 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
HOXD13P35453 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
HOXD13P35453 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
HOXD13P35453 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
HOXD13P35453 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
HOXD13P35453 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
HOXD13P35453 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
HOXD13P35453 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
HOXD13P35453 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
HOXD13P35453 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
HOXD13P35453 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
HOXD13P35453 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
HOXD13P35453 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
HOXD13P35453 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
HOXD13P35453 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
HOXD13P35453 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
HOXD13P35453 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
HOXD13P35453 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
HOXD13P35453 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
HOXD13P35453 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
HOXD13P35453 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
HOXD13P35453 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
HOXD13P35453 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
HOXD13P35453 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
HOXD13P35453 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
HOXD13P35453 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
HOXD13P35453 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
HOXD13P35453 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
HOXD13P35453 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
HOXD13P35453 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
HOXD13P35453 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
HOXD13P35453 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
HOXD13P35453 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
HOXD13P35453 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
HOXD13P35453 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
HOXD13P35453 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
HOXD13P35453 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
HOXD13P35453 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
HOXD13P35453 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
HOXD13P35453 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
HOXD13P35453 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
HOXD13P35453 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
HOXD13P35453 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC23.22■■□□□ 1.31
HOXD13P35453 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
HOXD13P35453 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
HOXD13P35453 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
HOXD13P35453 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
HOXD13P35453 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
HOXD13P35453 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.3 ms